骨髄異形成症候群造血幹細胞移植症例におけるゲノム解析に基づいた革新的予後予測モデルの構築
研究課題情報
- 課題管理番号
- 17cm0106422h0002
- 9つの連携分野プロジェクト
ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト
- 事業名
次世代がん医療創生研究事業
- タグ(2017)
研究の性格: 医薬品・医療機器等の開発を目指す研究<医療機器開発につながるシステム開発を含む>
開発フェーズ: 応用
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: 新生物
- タグ(2016)
研究の性格: 医薬品・医療機器等の開発を目指す研究<医療機器開発につながるシステム開発を含む>
開発フェーズ: 応用
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: 新生物
- 代表研究機関
- 国立大学法人京都大学
- 研究代表者
(2017) 吉里哲一, 国立大学法人京都大学, 大学院医学研究科 腫瘍生物学講座・助教
(2016) 吉里哲一, 国立大学法人京都大学, 大学院医学研究科 腫瘍生物学・助教
- 研究期間
- 2016年度 - 2017年度
- 課題への総配分額
- 19,500 千円
- 研究概要(2017)
- 平成28年度に引き続き、ゲノム異常の骨髄異形成症候群移植症例における予後解析を実施し臨床判断に有用なバイオマーカーを探索する。また非移植症例のデータを2000例を目標に収集・解析する。更に、DDX41 germline変異を評価する。
- 研究概要(2016)
- 骨髄異形成症候群同種造血幹細胞移植症例の予後を改善するために日本骨髄バンクを介して同種骨髄移植を実施された症例に対して標的シーケンスを実施し、変異の予後に対する影響を評価する。約1000検体を目安に検体収集する。
研究成果情報
2017
2016
成果の概要
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同種造血幹細胞移植症例に有用な新たな予後予測モデルを構築することを目的として、日本骨髄バンクより、約800例の骨髄異形成症候群移植症例の末梢血DNAを入手し、次世代シーケンサを用いて69遺伝子を標的とした標的シーケンスを実施した。75%の症例に変異を、40%の症例にコピー数異常・アレル不均衡を同定した。ゲノム異常の予後に与える影響を多変量解析で評価したところ、TP53、NRAS、CBL変異、複雑核型が独立した予後不良因子として同定された。特に複雑核型を呈するTP53変異陽性例の予後は極めて不良であった。全ハザードの70%を臨床因子が占める一方、残りの30%をゲノム因子が占めることが明らかになった。この成果をBlood誌に発表した(Yoshizato et al., Blood 2017)。本研究のシーケンスデータはEuropean Genome-Phenome Archive (accession number EGAS00001001949)に登録した。本研究により複雑核型かつTP53変異陽性例の移植後の予後が極めて不良であることが明らかになったが、DNAメチル化阻害剤を投与すると一時的にではあるがTP53変異クローンが縮小することが報告されている。DNAメチル化阻害薬を移植前に投与しTP53変異クローンを縮小させてから移植をすることでTP53変異陽性例の予後を改善する可能性があり、DNAメチル化阻害剤であるazacitidineを用いた臨床研究「TP53変異陽性骨髄異形成症候群を対象としたアザシチジンと同種造血幹細胞移植の多施設共同非盲検無対照試験」(UMIN000027789)を開始した。DDX41胚細胞変異陽性ドナーから同種造血幹細胞移植を実施すると、移植後にドナー由来血液腫瘍を発症するリスクが上昇する可能性があるが、これまで日本人におけるDDX41胚細胞変異は報告されていなかったため本コホートを用いて評価したところ、DDX41 p.A500 frame shiftが約1.9%の症例で観察された。本研究で明らかになった骨髄異形成症候群におけるDDX41胚細胞変異の頻度のエビデンスを応用することで、ドナーの最適化が図れ、それによりドナー・レシピエント双方に利益をもたらすことが期待される。
学会誌・雑誌等における論文一覧
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1. Shiozawa Y, Malcovati L, Galli A, Pellagatti A, Karimi M, Sato-Otsubo A, Sato Y, Suzuki H, Yoshizato T, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Makishima H, Boultwood J, Hellstrom-Lindberg E, Miyano S, Cazzola M, Ogawa S. Gene expression and risk of leukemic transformation in myelodysplasia. Blood, 2017, 130(24), 2642-2653, doi: 10.1182/blood-2017-05-783050.
2. Negoro E, Nagata Y, Clemente MJ, Hosono N, Shen W, Nazha A, Yoshizato T, Hirsch C, Przychodzen B, Mahfouz RZ, Kuzmanovic T, Sekeres MA, Makishima H, Ogawa S, Maciejewski JP. Origins of myelodysplastic syndromes after aplastic anemia. Blood, 2017, 130(17), 1953-1957, doi: 10.1182/blood-2017-02-767731.
3. Kako S, Kanda Y, Kato J, Yamamoto W, Kato S, Onizuka M, Yokota A, Tatara R, Yokoyama H, Hagihara M, Usuki K, Gotoh M, Watanabe R, Kawai N, Saitoh T, Kanamori H, Takahashi S, Okamoto S. The bridge treatment selection at the decision of transplantation did not affect the outcomes in patients with advanced myelodysplastic syndromes. Hematological Oncology, 2017, 35:341-349, doi: 10.1002/hon.2276.
4. Hayakawa J, Kanda J, Akahoshi Y, Harada N, Kameda K, Ugai T, Wada H, Ishihara Y, Kawamura K, Sakamoto K, Ashizawa M, Sato M, Terasako-Saito K, Kimura SI, Kikuchi M, Yamazaki R, Kako S, Kanda Y. Meta-analysis of treatment with rabbit and horse antithymocyte globulin for aplastic anemia. International Journal of Hematology, 2017, 105(5), 578-586, doi: 10.1007/s12185-017-2179-3.
5. Kako S, Akahoshi Y, Harada N, Nakano H, Kameda K, Ugai T, Yamasaki R, Wada H, Ishihara Y, Kawamura K, Sakamoto K, Sato M, Ashizawa M, Terasako-Saito K, Kimura SI, Kikuchi M, Nakasone H, Yamazaki R, Kanda J, Kanda Y. HLA-mismatched haploidentical transplantation using low-dose anti-thymocyte globulin (ATG: thymoglobulin). Hematology, 2017, 22(3), 129-135, doi: 10.1080/10245332.2016.1231968.
6. Yokoyama H, Kanda J, Fuji S, Kim SW, Fukuda T, Najima Y, Ohno H, Uchida N, Ueda Y, Eto T, Iwato K, Kobayashi H, Ozawa Y, Kondo T, Ichinohe T, Atsuta Y, Kanda Y; HLA Working Group of the Japan Society for Hematopoietic Cell Transplantation.., Impact of Human Leukocyte Antigen Allele Mismatch in Unrelated Bone Marrow Transplantation with Reduced-Intensity Conditioning Regimen., Biol Blood Marrow Transplant., 2017, 23(2), 300-309, doi: 10.1016/j.bbmt.2016.11.009.
7. Yanada M, Kurosawa S, Kobayashi T, Ozawa Y, Kanamori H, Kobayashi N, Sawa M, Nakamae H, Uchida N, Hashimoto H, Fukuda T, Hirokawa M, Atsuta Y, Yano S., Reduced-intensity conditioning allogeneic hematopoietic cell transplantation for younger patients with acute myeloid leukemia: a registry-based study., Bone Marrow Transplant., 2017, 52(6), 818-824, doi: 10.1038/bmt.2016.358.
8. Fujiwara H, Fuji S, Wake A, Kato K, Takatsuka Y, Fukuda T, Taguchi J, Uchida N, Miyamoto T, Hidaka M, Miyazaki Y, Tomoyose T, Onizuka M, Takanashi M, Ichinohe T, Atsuta Y, Utsunomiya A; ATL Working Group of the Japan Society for Hematopoietic Cell Transplantation.., Dismal outcome of allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for relapsed adult T-cell leukemia/lymphoma, a Japanese nation-wide study., Bone Marrow Transplant., 2017, 52(3), 484-488, doi: 10.1038/bmt.2016.313.
9. Konuma T, Kondo T, Yamashita T, Uchida N, Fukuda T, Ozawa Y, Ohashi K, Ogawa H, Kato C, Takahashi S, Kanamori H, Eto T, Nakaseko C, Kohno A, Ichinohe T, Atsuta Y, Takami A, Yano S; Adult Acute Myeloid Leukemia Working Group of the Japan Society for Hematopoietic Cell Transplantation (JSHCT).., Outcome of allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in adult patients with acute myeloid leukemia harboring trisomy 8., Ann Hematol., 2017, 96(3), 469-478, doi: 10.1007/s00277-016-2909-2.
10. Okada A, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Shiraishi Y, A framework for generating interactive reports for cancer genome analysis. Journal of Open Source Software,2017, 2(20), 457, doi:10.21105/joss.00457.
学会・シンポジウム等における口頭・ポスター
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1. Impact of genetic abnormalities on outcome in patients with MDS after stem-cell transplantation. 口頭, Tetsuichi Yoshizato, The Nordic MDS Group (NMDSG) meeting 2017 autumn 2017/11/9, 国外
国外 / 口頭
2. Somatic mutation in MDS and its effect on outcome, 口頭, Tetsuichi Yoshizato,第79回日本血液学会学術集会, 2017/10/22, 国内
国内 / 口頭
3. U2AF2 mutations in myelodysplastic syndromes, 口頭, Tetsuichi Yoshizato, Yasuhito Nannya, Yoshiko Atsuta, Yusuke Shiozawa, Kenichi Yoshida, Makoto Onizuka, Keisuke Kataoka, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Yuichi Shiraishi, Masashi Sanada, Hidehiro Itonaga, Yoshinobu Kanda, Yasushi Miyazaki, Satoru Miyano, Hideki Makishima, Seishi Ogawa,第79回日本血液学会学術集会, 2017/10/21, 国内
国内 / 口頭
4. U2AF2 mutations in myelodysplastic syndromes, 口頭, Tetsuichi Yoshizato, Yasuhito Nannya, Yoshiko Atsuta, Yusuke Shiozawa, Kenichi Yoshida, Keisuke Kataoka, Yuichi Shiraishi, Masashi Sanada, Yoshinobu Kanda, Yasushi Miyazaki, Satoru Miyano, Hideki Makishima, Seishi Ogawa,第76回日本癌学会学術総会, 2017/9/29, 国内
国内 / 口頭
5. Genomon Hotspot Mutation Call: a tool for hotspot somatic mutation detection in cancer hotspots, 口頭, Kenichi Chiba, Yuichi Shiraishi, Ai Okada, Satoru Miyano, 第77回日本癌学会学術総会、2017/9/29, 国内
国内 / 口頭
6. The landscape of splicing associated variants revealed by large scale whole exome and transcriptome analysis, 口頭, Yuichi Shiraishi, Keisuke Kataoka, Kenichi Chiba, Ai Okada, Hiroko Tanaka, Seishi Ogawa, Satoru Miyano,第77回日本癌学会学術総会、2017/9/29,国内
国内 / 口頭
7. Clonal evolution in MDS from clonal hematopoiesis to acute leukemia, 口頭, Masashi Sanada,The 2nd JSPS-NUS Joint Symposium, 2018/1/19,国内
国内 / 口頭
8. Clonal Analysis of Acute Myeloid Leukemia Secondary to Myeloproliferative Neoplasms, ポスター, Yoko Ushijima, Yuichi Ishikawa, Hikaru Hattori, Naomi Kawashima, Shun Fujiwara, Seitaro Terakura, Masashi Sanada, Hitoshi Kiyoi, 59th American Society of Hematology (ASH) Annual Meeting and Exposition, 2017/12/10, 国外
国外 / ポスター
9. Specific effect of azacitidine for TP53(+) MDS, 口頭, Yasuhito Nannya, June Takeda, Shinya Sato, Yusuke Shiozawa, Yuichi Shiraishi, Keisuke Kataoka, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Masashi Sanada, Shigeru Chiba, Norio Asou, Hitoshi Kiyoi, Shinji Nakao, Kazuma Ohyashiki, Yasushi Miyazaki, Tomoki Naoe, Hideki Makishima, Kenichi Yoshida, Satoru Miyano, Seishi Ogawa, 第79回日本血液学会学術集会, 2017/10/21, 国内
国内 / 口頭
10. Clonal analysis of acute myeloid leukemia transformed from myeloproliferative neoplasms, 口頭, Ushijima Yoko, Yuichi Ishikawa, Hikaru Hattori, Naomi Kawashima, Shun Fujiwara, Seitaro Terakura, Masashi Sanada, Hitoshi Kiyoi,第79回日本血液学会学術集会, 2017/10/21, 国内
国内 / 口頭