本研究では、アルツハイマー病をはじめとする神経変性疾患の超早期病変を検出し、その進行を空間的・分子的に解析するための「大規模セルオミクス基盤」を構築する。従来の二次元切片では見落とされがちな微小で散在性の病変を、改良型の組織透明化技術とライトシート顕微鏡を用いた3D全細胞解析で網羅的に捉える。特に、ヒト剖検脳標本への応用拡張を念頭に、大型ライトシート顕微鏡を新たに開発し、大規模標本へ活用可能な画像取得・解析手法を確立する。本基盤により、神経細胞脱落に先立つ微小なミクログリア減少現象(ミクログリアセキュリティーホール)をはじめとする早期病変を可視化・検証し、病変部位の分子情報を空間トランスクリプトーム解析などと組み合わせて詳細に明らかにすることを目指す。将来的にヒト脳全域にわたる超早期段階からの細胞・分子メカニズムの病態マップの構築、および、早期診断・治療開発へ寄与する。