脳の仕組みを理解するには、脳の機能と構造の両面を計測する技術の発展が不可欠である。機能計測においては、近年、カルシウムや膜電位、神経調節因子等のイメージングが可能になり、特に2光子顕微鏡の登場により広範囲かつ深部の観察が進んだ。しかし、大脳皮質の深層や皮質下の詳細な観察や高速なダイナミクスの計測においては新たな技術が必要である。一方、脳の構造計測については、3D電子顕微鏡や脳透明化技術の発展により、大規模な観察が可能になったが、データ解析の困難さ課題となっており、標識方法に関してはまだ発展の余地がある。そこで、本研究では、生体脳の長期イメージング法の開発とメゾコネクトームの多重解析法の開発に取り組む。