エムポックスは、これまでアフリカ大陸の一部に限局していた人獣共通感染症であり、主に野生動物との接触を通じて感染していた。エムポックスウイルス（MPXV）は天然痘ウイルスと同属のオルソポックスウイルスに属し、天然痘ワクチンによる交差免疫がヒトでのエムポックス感染を抑制してきた。しかし、21世紀に入り、人口集団中の天然痘ワクチン接種者が減少するにつれ、MPXVは継続的に拡大を続け、2022年に世界的なパンデミックを引き起こした。その後、2023年にはコンゴ民主共和国（DRC）を中心に再びエムポックスが拡大し、2024年8月には世界保健機関（WHO）によりPublic Health Emergency of International Concern（PHEIC）が再度宣言された。
本研究の目的は、DRC拠点で収集されたエムポックス患者由来の病変スワブ検体を用い、MPXVの全ゲノム解析を実施し、ゲノムワイド関連解析を行うことで、MPXVの遺伝的多様性と宿主の相互作用を解明することにある。
2024年度は、これまで大阪公立大学がDRCおよび日本において収集しているエムポックス患者の病変スワブ由来検体を用いてMPXVゲノム解析を実施した。病変スワブ16サンプルのショートリードシークエンスを行った。16サンプルのシークエンスを行い、平均104Gbpのデータを得た。2025年度にはこのデータを解析し、エムポックスのゲノム多型を検出する予定である。