我々はタイにおける「多剤耐性腸内細菌科細菌の病原性メカニズムの解明」と「汎耐性菌の発生・拡散動向と耐性機構の解明」という大きく二つのテーマを柱として研究を行っている。
2024年度は菌株の収集とそれらのゲノムシークエンスを行うことが主な目標であった。これまで我々は大阪大学微生物病研究所・日本タイ感染症共同研究センターの耐性菌研究として、タイ全土からカルバペネム耐性腸内細菌科細菌（CRE）を収集してきており、2024年度は汎耐性菌を含む収集株600株を国立感染症研究所と共有した。全体としてはこれまで2300株を収集しており、計画通りに菌株収集を進めているが、さらに追加の株を加えつつ解析を行っていく。これらの菌株については国立感染症研究所において保存され、薬剤耐性に関わる研究者に向けて随時一般公開を行なっていく予定である。また、シークエンス解析について2024年度に追加された菌株のDNA調製を行なってシークエンス解析を始めており、2025年度も継続予定である。
研究代表者はこれらの菌株収集・管理を総括しつつ、ゲノムデータの解析を行っている。これまでシークエンス済みの株に合わせて、データベース上のCRE株についてのゲノム情報を収集後、病原性に関する解析を開始しており、2025年度の解析に繋げていく予定である。汎耐性については既にシークエンス済みの菌株を中心に解析を始めており、今後バンコクおよび地方都市からの追加収集株を合わせて解析を進める予定である。