HCV排除後の遺伝子多型解析
BBJの情報収集、■第1コホート（ウイルス駆除）肝がん登録問わず・・・人数：596、調査実施日数：691　肝がん登録あり（肝がんの調査実施日問わず）・・・人数62、調査実施日数：300　■第2コホート（SVR）　肝がん登録問わず・・・人数：488、調査実施日数：946　肝がん登録あり（肝がんの調査実施日問わず）・・・人数73、調査実施日数：372　（135名、慢性C型肝炎でSVRかつ肝癌登録あり）。SVR時期と発癌時期の調査を行うが、広島大学の肝臓内科医のメンバーがデータにアクセスできるようにBBJのIRBを申請手続きを行っている。また、広島大学および広島大学関連施設フォロー中のHCV排除後患者816のゲノムを追加でSNPアレイに提出する予定である。全例のSVR時の臨床情報、および予後調査の更新が終了し、現在は、SNPアレイに提出するための学内手続き、サンプルの濃度調整を行っている。
空間プロファイリング
FFPEを6mm四方に切り出し、指定の領域に貼り付け、HE染色を行うというライブラリー調整の準備が完了した。並行して、FFPEからRNAを抽出、クオリティチェックを行い、12症例分の解析サンプルは決定した。本番のサンプルでライブラリー調整を開始したが、Visium カセットが変形していた関係（初期不良）で、スライドをはめ込んだ際に、スライドガラスが割れてしまい（10xGenomicsからスライドは補填）やり直しとなった。2024年度の第一四半期には、4枚（16サンプル）のデータ取得ができると考えている。
免疫染色
ICGC手術検体については、CD3,CD8等の免疫微小環境関連マーカーの染色を施行し、whole slide image fileを作成した。
イメージングバイオマーカー
まず、パイロット的免疫療法を行った症例のうち、奏効例、非奏効例3例ずつのEOB-MRI、PET-CTの解析を行った。画像解析項目は以下の通り：Size、Gross classification(肝small nodular type with indistinct margin／simple nodular type(with distinct margin), ／simple nodular type with extranodular growth／confluent multinocular type／infiltrative type）、Tumor margin(irregula／smooth／Peritumoral hypointensity（肉眼携帯をEOB-MRI肝細胞相で評価)、皮膜（門脈相と移行相で評価）、脂肪含有（Dual-T1WIで評価）、造影効果（rim enhancement、peritumoral Arterialenhancement／intratumoral vessel non-rim dh-APHE／>50% hypovascular component）（動脈相で評価）、DWI、脂肪抑制T2WI、造影前脂肪抑制T1WI、動脈相、門脈相、移行相造影後脂肪抑制T1WI　肝細胞造影相における信号強度、PET-CTのSUV。このうち、いくつか傾向差を認める項目あり、引き続き症例数を増やして解析を進めている。