本研究は既に取得済みの大腸癌全ゲノムシークエンスデータを利用し、HLA提示抗原を直接シークエンス可能なプロテオミクス解析技術である「イムノペプチドーム解析」を融合することで、個別化がん免疫療法の標的となり得るネオ抗原配列のOff-The-Shelfライブラリ作成、非コーディング領域由来を含む日本人HLA提示抗原データベース（Immunopeptide ATLAS）構築と公開を目的とする。
令和5年度は大腸癌全ゲノムシークエンスデータ（正常部、癌部ペア）からアミノ酸配列に変化を伴う体細胞変異を抽出し、変異配列を含む個別化全タンパク質配列データベース構築を開始した。ここで、より臨床実用性が高い成果が得られるよう、日本人が高頻度に持つHLAアロタイプを保有する症例に解析を絞り込んだ。具体的には全ゲノムシークエンス情報が付加された全240症例のうち、HLA-A、B、Cの全6アレルにおいてHLA-A24:02 (37.8%)、HLA-A02:01 (23.7%)、HLA-B52:01 (10.9%)、HLA-B15:01 (9.4%)、HLA-B35:01 (8.8%)、HLA-B40:02 (8.4%)、HLA-C01:02 (16.6%)、HLA-C03:04 (13.8%)、HLA-C03:03 (13.2%)｛括弧内は日本人における各HLAアロタイプ頻度｝に3つ以上合致する96症例（癌部、正常部192サンプル）を解析対象として抽出した。これらの症例において提示されているHLA Class-I提示抗原情報は日本人の大多数をカバーできるリソースとなると考えられる。
一方、組織検体からHLA Class-I提示抗原ペプチドを単離精製し、そのLC/MS分析によって最大数の抗原ペプチド同定数が得られるよう、従前の技術に加えてイオンモビリティー気相分画を利用した分析条件の至適化も行った。