日本人がん患者のゲノムデータ、疾患モデルであるPDXのオミックス情報を利活用する統合データベースの作成し、アンメットメディカルニーズであるがん治療薬の開発支援を目的とするAIを用いた統合解析システムの構築の準備を始めた。国立がん研究センターでは、既に取得済みのデータフォーマットの確認とAI研究利用のための環境整備と契約を行った。治療予測モデルを構築するための基盤データを構築するため、マウスゲノムがコンタミしているPDXに対してメチル化解析が実施可能であるかを検討した。さらに既取得全エクソンシークエンス並びにトランスクリプトームのデータ解析を実施し、データベース構築に必要な解析結果の取りまとめを行った。さらに、PDXタンパク質解析について、質量分析を用いたプロテオーム解析に関わる測定条件の検討を行った。ヒューマノーム研究所では、本事業に関わるアカデミア、製薬会社からヒアリングを実施することで、PDXマウスを活用したAIシステム開発の詳細設計を進めた。特にAI開発に重要となるデータ・データベースの策定を進め、PDXマウスから得られるデータだけでなく、公共データベースにて公開されている実験データの取り込みによる、AI用データベースの開発に目処をつけた。星薬科大学では、樹立されたPDXのオミックス解析を行うにあたりPDX検体のメチル化レベルがヒト検体同様に測定できるかを評価するため、ヒトDNAとマウスDNAを混ぜた検体がメチル化レベルにどの程度影響を与え得るか検討を行った。一般的なPDX検体における腫瘍含有率が60-80%程度という点を考慮すると、今回メチル化レベルが10%以上ずれる領域を除外すれば、本方法によるメチル化解析が十分な精度が担保できると考えられた。製薬企業である、Chordia Therapeutics並びにエーザイからは、既に取得済みの非公開社内データ、ならびに、臨床試験データをAI学習させるための契約ならびに期待されるアウトプットについても議論された。