細胞内の膜を持たない構造体（非膜性構造体、生体分子凝集体）の作動原理として液-液相分離と呼ばれる現象が注目されている。さまざまなタンパク質に含まれる、一定の構造を取りにくい天然変性領域（intrinsically disordered region, IDR）は生体分子凝集体の形成の主要な駆動力であり、プロテオームに含まれるタンパク質の約60%が何らかの天然変性領域を有することが知られている。近年、天然変性領域と神経発達障害やがんなどの疾患との関係が注目されつつあるが、天然変性領域の配列の変化（変異）がどのような機能の変化につながるかはほとんどよく分かっていない。本研究では、自閉スペクトラム症（ASD）などに関連したクロマチン制御因子の天然変性領域VUSを主に対象として、天然変性領域VUSの体系的機能アトラスを構築することを目的とする。
令和６年度では、(1) 転写・クロマチン凝集体の制御機構、(2) 転写・クロマチン凝集体の構成成分の網羅的プロファイリング、(3) 自閉スペクトラム症（ASD）などに関連したクロマチン制御因子の天然変性領域バリアントを対象としたスクリーニング系の構築などについて主に研究開発を進めた。 転写・クロマチン凝集体の制御機構については、RNAの転写・分解が転写・クロマチン凝集体の形成・離散を制御していることを明らかにし、物理学的なシミュレーション、超解像イメージング、マルチオミクス解析、シングルセルオミクス解析などを統合することにより、転写・クロマチン凝集体の流動性がエンハンサー介した協調的な遺伝子制御を制御することを明らかにした（論文投稿準備中）。また、自閉スペクトラム症（ASD）などに関連したクロマチン制御因子の天然変性領域バリアントを対象としたスクリーニング系の構築については、まず、ASDに関連するゲノム異常のデータベースを統合解析することにより、天然変性領域にバリアントがみられやすい候補遺伝子を同定した。さらに、候補遺伝子の天然変性領域が転写制御に与える影響を解析するためのレポーターアッセイを構築し、機械学習を用いて天然変性領域の構造状態を予測するシステムなどを構築した。令和７年度では、天然変性領域VUSの分子生物学的スクリーニングなどに研究の焦点をおいて、研究開発を実施する。