- 課題管理番号
- 25jf0126005h0003
- 統合プロジェクト(三期)
シーズ開発・基礎研究プロジェクト
- 統合プロジェクト(二期)
シーズ開発・研究基盤プロジェクト<第二期>
- 事業名
医療分野国際科学技術共同研究開発推進事業
- タグ(2025)
研究開発目的: 基礎医学研究
研究の性格: 疾患を特定した基礎医学研究<生命・病態解明研究>
研究モダリティ: in silico<データサイエンスやシミュレーション等>
ICD-10大分類: 呼吸器系の疾患
対象疾患領域: 難病 , 生活習慣病<免疫アレルギー疾患、腎疾患を含む> , 感染症
特記的事項: 研究倫理<ELSI/RRI等> , 国際共同研究 , 病原体の研究
補足確認: 予防・保健 , 診断 , 治療 , 予後・生活の質<QOL>
- タグ(2024)
研究開発目的: 基礎医学研究
研究の性格: 疾患を特定した基礎医学研究<生命・病態解明研究>
研究モダリティ: in silico<データサイエンスやシミュレーション等>
ICD-10大分類: 呼吸器系の疾患
対象疾患領域: 難病 , 生活習慣病<免疫アレルギー疾患、腎疾患を含む> , 感染症
特記的事項: 研究倫理<ELSI/RRI等> , 国際共同研究 , 病原体の研究
補足確認: 予防・保健 , 診断 , 治療 , 予後・生活の質<QOL>
- タグ(2023)
研究開発目的: 基礎医学研究
研究の性格: 疾患を特定した基礎医学研究<生命・病態解明研究>
研究モダリティ: in silico<データサイエンスやシミュレーション等>
ICD-10大分類: 呼吸器系の疾患
対象疾患領域: 難病 , 生活習慣病<免疫アレルギー疾患、腎疾患を含む> , 感染症
特記的事項: 研究倫理<ELSI/RRI等> , 国際共同研究 , 病原体の研究
補足確認: 予防・保健 , 診断 , 治療 , 予後・生活の質<QOL>
- 代表研究機関
- 国立大学法人福井大学
- 研究代表者
(2025) 藤枝重治, 国立大学法人福井大学, 学術研究院医学系部門・教授
(2024) 藤枝重治, 国立大学法人福井大学, 学術研究院医学系部門・教授
(2023) 藤枝重治, 国立大学法人福井大学, 学術研究院医学系部門・教授
- 研究期間
- 2023年度 - 2028年度
- 課題への総配分額
- 81,876 千円
- 研究概要(2025)
- 日米の比較から見出された日米に特異的もしくは共通エンドタイプの遺伝子発現について、別検体を用いたqPCR、ELISAにてmRNAレベル、タンパク質レベルでの再現性を確認する。DNA解析によるジェノタイプ分析では米国検体を用いて実施し日米の比較を行う。マイクロバイオーム解析では米国検体を用いて実施し日米の比較を行う。Single cell RNA解析ではbulk RNA-seqデータを用いて、各症例における細胞分画とその細胞量の推定(deconvolution)を行い日米の比較を行う。ノースウエスタン大学アレルギー免疫学研究室に所属する博士研究員を日本で開催される学会へ招聘し講演を行う。日本側も米国・欧州で開催される学会に参加し日米のネットワーク構築を図る。日本の若手研究者(研究参加者:木戸口正典)をノースウエスタン大学に派遣する。学会には日米の若手研究者も参加・発表し、互いにディスカッションし交流を深め、ハンズオンセミナーでは講師を担当する。米国の若手研究者(研究参加者:Junqin Bai)を日本に派遣し、マイクロバイオーム解析に関する実験や解析手法を習得させる。
- 研究概要(2024)
- 慢性副鼻腔炎のbulk RNA-seq解析によるエンドタイプ分析では米国検体に加え日本検体を米国へ輸送し実施する。DNA解析によるジェノタイプ分析では日本検体を用いて実施する。マイクロバイオーム解析では日本検体を用いて実施する。single cell RNA解析では令和5年に引き続き実施する。ノースウエスタン大学アレルギー免疫学研究室に所属する博士研究員を日本で開催される学会へ招聘しワークショップを行う。また、日本側も米国および欧州で開催される学会に参加し日米および日欧のネットワーク構築を図る。オンラインでの定期ミーティングに加え、学会前後では対面でミーティングを行い、本研究の進捗状況の確認と研究遂行に向けた議論を行う。日本の若手研究者をノースウエスタン大学に派遣する。東京で行われる学会および米国で行われるAAAAIに日米の若手研究者が参加・発表し、互いにディスカッションし交流を深める。月に1回程度、日米若手研究者による抄読会や討論会をオンラインで行う。
- 研究概要(2023)
- 米国検体を用いて慢性副鼻腔炎のbulk RNA-seq解析によるエンドタイプ分析、慢性副鼻腔炎の組織を利用したsingle cell RNA解析を開始する。日米検体の相手国での検体利用について、日米施設の倫理委員会へ変更申請を行い、日米で並行して追加の検体収集を行う。本研究に関してオンラインでのミーティングを行い、日米での研究内容や倫理書類を含めた準備状況について再確認をする。日本の若手研究者(研究参加者:木戸口正典、岡愛子)をノースウエスタン大学に派遣する。日米の若手研究者が米国最大のアレルギー学会であるAmerican Academy of Allergy, Asthma & Immunology(AAAAI)に参加・発表し、互いにディスカッションし交流を深める。
研究開発項目1「慢性副鼻腔炎のbulk RNA解析によるエンドタイプ分析」
日本の若手研究者(海外派遣研究者:岡愛子)をノースウエスタン大学アレルギー免疫学研究室(相手国側研究者:Atsushi Kato)に派遣し、米国の慢性副鼻腔炎患者の鼻茸、鼻粘膜サンプルを用いたbulk RNA-seqの実験や解析手法を習得した。すでにノースウェスタン大学で相手国側研究者(Atsushi Kato)が収集したbulk RNA-seqデータを用いて、既知のエンドタイプ分類の再現性確認や、新規エンドタイプを探索した。また、岡愛子は生物学的製剤のひとつである抗TSLPモノクローナル抗体薬(Tezepelumab)が、全長TSLPおよび高活性な切断型TSLPの両方の活性を阻害することを明らかにし、2型炎症エンドタイプとして鼻茸を伴う慢性副鼻腔炎のほかに鼻茸を伴わない慢性副鼻腔炎にとっても重要な治療の選択肢となる可能性を示した(Oka A, Kidoguchi M, Fujieda S, Okano M, Kato A, et al. J Allergy Clin Immunol 2025 in press)。
研究開発項目2「慢性副鼻腔炎のDNA解析によるジェノタイプ分析」
国際共同研究の準備として、日米検体の相手国での検体やデータ利用について、福井大学とノースウェスタン大学との間で共同研究契約を締結した。また、研究開発代表者(藤枝重治)、相手国側研究者(Atsushi Kato)、海外派遣研究者(木戸口正典)が中心となって、それぞれ日米施設の倫理委員会へ変更申請を行い、追加の検体収集を行った。
研究開発項目3「慢性副鼻腔炎のマイクロバイオーム解析」
国際共同研究の準備として、日米検体の相手国での検体やデータ利用について、福井大学とノースウェスタン大学との間で共同研究契約を締結した。また、研究開発代表者(藤枝重治)、相手国側研究者(Atsushi Kato)、海外派遣研究者(木戸口正典)が中心となって、それぞれ日米施設の倫理委員会へ変更申請を行い、追加の検体収集を行った。
研究開発項目4「慢性副鼻腔炎の組織を利用したsingle cell RNA解析」
日本の若手研究者(海外派遣研究者:木戸口正典)をノースウエスタン大学アレルギー免疫学研究室(相手国側研究者:Atsushi Kato)に派遣し、採取した鼻茸を単細胞に分離し、single cell RNA-seq解析を行った。測定したデータはSeven Bridges Platform (Seven Bridges Genomics)や解析ソフトR(Seurat)を用いて単細胞ごとの網羅的な遺伝子発現データを取得し、各細胞のクラスター分析を行った。また、本研究課題に先駆けて、鼻茸組織中の好酸球ならびに好中球のsingle cell RNA-seq解析を行い、鼻茸組織中には好酸球と好中球はそれぞれ4つずつのサブタイプが存在することを明らかにした(Iwasaki N, Oka A, Kidoguchi M, Kato A, et al. J Allergy Clin Immunol 2024; 154: 952-964. Iwasaki N, Kidoguchi M, Oka A, Kato A, et al. J Allergy Clin Immunol 2025; 155: 843-855.)。特に好酸球については、世界で初めて組織から好酸球をsingle cell RNA-seq解析で同定する技法を示し、掲載誌のThe Editor’s Choiceにも選ばれ注目を浴びている。
【国際ネットワーク構築・拡大】
ノースウエスタン大学アレルギー免疫学研究室に所属する相手国側研究者(Robert C Kern, Anju T Peters, Whitney W Stevens, Bruce K Tan, Atsushi Kato)や相手国側若手研究者(Junqin Bai, Aditi Agarwal)を日本で開催される学会(ISIAN & ERS 2024および日本耳鼻咽喉科臨床学会)へ招聘し、講演ならびに意見交換を行った。また、日本側(研究代表者:藤枝重治、研究分担者:岡野光博、海外派遣研究者:木戸口正典、岡愛子)も米国および欧州で開催される学会(American Academy of Allergy, Asthma & Immunology:AAAAI、European Academy of Allergy & Clinical Immunology:EACCI)に参加し、日米および日欧のネットワーク構築を図った。オンラインでの定期ミーティングに加え、ISIAN & ERS 2024学会前後では対面でミーティングを行い、本研究の進捗状況の確認と研究遂行に向けた議論を行った。
【国際頭脳循環等の促進に資する次世代研究者の人材育成】
日本の若手研究者(海外派遣研究者:木戸口正典、岡愛子)をノースウエスタン大学に派遣した。東京で行われたISIAN & ERS 2024の学会および米国で行われたAAAAI 2025に日米の若手研究者(海外派遣研究者:木戸口正典、岡愛子)が参加・発表し、互いにディスカッションし交流を深めた。AAAAI 2025では木戸口正典・岡愛子・Junqin Bai・Aditi AgarwalがそれぞれPhD Travel Scholarshipを受賞し、岡愛子はBest Abstract Awardも同時に受賞した。