本研究開発は、空間オミクス計測技術、ヒト肺胞オルガノイド、遺伝子発現ネットワーク解析手法を統合して、肺上皮の分化ポテンシャル予測モデル、および、がん進展予測モデルを作成し、肺がん進展予測プラットフォームの構築を目指すものである。当該年度では、肺オルガノイドの培養系の立ち上げに向けて準備を開始した。またトランスクリプトームネットワークのリファレンス作成のために、非がんオルガノイドの空間トランスクリプトーム計測を実施した。空間的シングルセルトランスクリプトーム計測技術Xenium 5kにて、コントロールの未刺激オルガノイドとブレオマイシン刺激オルガノイドに対して遺伝子発現計測を実施した。細胞あたり400以上の遺伝子が検出され、クラスタリング解析の結果、肺上皮の分化やストレス応答状態に関わる遺伝子群によって上皮細胞をいくつかの集団に分けることができた。また、Xenium解析後の切片を用いた多重蛍光免疫染色PhenoCyclerの実験条件検討を実施し、RNAとタンパク質発現の同時計測ができることを確認した。次に、肺がん進展モデル構築に向けて、リアルワールドデータとして本研究グループの先行研究にて取得した肺腺癌30例のVisiumおよびXeniumデータ（Takano Y et al. 2024 Nat Commun）の再解析を行った。これにより実際の肺がん組織のがん細胞にて発現が見られる遺伝子発現ネットワークの抽出を行った。