研究課題情報
課題管理番号
25gm7010002h0002
統合プロジェクト(三期)

シーズ開発・基礎研究プロジェクト

統合プロジェクト(二期)

シーズ開発・研究基盤プロジェクト<第二期>

事業名

革新的先端研究開発支援事業

タグ(2025)

研究開発目的: 基礎医学研究

研究の性格: 疾患を特定しない基礎医学研究<生命・病態解明研究>

研究モダリティ: in vitro

ICD-10大分類: 該当なし<対象とする疾患なし>

対象疾患領域: その他

特記的事項: 国際共同研究

タグ(2024)

研究開発目的: 基礎医学研究

研究の性格: 疾患を特定しない基礎医学研究<生命・病態解明研究>

研究モダリティ: in vitro

ICD-10大分類: 該当なし<対象とする疾患なし>

対象疾患領域: その他

特記的事項: 国際共同研究

代表研究機関
国立大学法人京都大学
研究代表者

(2025) 井上詞貴, 国立大学法人京都大学, 高等研究院 ヒト生物学高等研究拠点 特定准教授

(2024) 井上詞貴, 国立大学法人京都大学, 高等研究院 ヒト生物学高等研究拠点 特定准教授

研究期間
2024年度 - 2027年度
課題への総配分額
23,530 千円
研究概要(2025)
疾患や表現型個人差、進化の遺伝的要因は、遺伝子コード領域の変異というより、エンハンサーが担う遺伝子発現制御の差異に由来するとされる。しかしながら、非コードゲノムの中から疾患・個人差の真の原因となる原因SNPを実験的に特定することはこれまで困難であった。そこで本研究では、大規模並列レポーターアッセイ法(MPRA)を利用することで、神経前駆細胞で機能するエンハンサーの大規模機能解析および1塩基レベル機能解析を行い、過去最大規模かつ1塩基解像度のエンハンサー活性定量化を実現する。さらに、これを訓練データとした機械学習を行い、遺伝子発現制御に対する1塩基バリアントエフェクト予測を可能とする。これにより、エンハンサー機能を1塩基解像度で解析・予測する技術基盤を確立し、疾患・個人差を生み出す分子メカニズムの理解を目指す。
研究概要(2024)
疾患や表現型個人差、進化の遺伝的要因は、遺伝子コード領域の変異というより、エンハンサーが担う遺伝子発現制御の差異に由来するとされる。しかしながら、非コードゲノムの中から疾患・個人差の真の原因となる原因SNPを実験的に特定することはこれまで困難であった。そこで本研究では、大規模並列レポーターアッセイ法(MPRA)を利用することで、神経前駆細胞で機能するエンハンサーの大規模機能解析および1塩基レベル機能解析を行い、過去最大規模かつ1塩基解像度のエンハンサー活性定量化を実現する。さらに、これを訓練データとした機械学習を行い、遺伝子発現制御に対する1塩基バリアントエフェクト予測を可能とする。これにより、エンハンサー機能を1塩基解像度で解析・予測する技術基盤を確立し、疾患・個人差を生み出す分子メカニズムの理解を目指す。
研究成果情報
2024