本研究は，Gag-Pol mRNAのリボソームフレームシフト機構，ならびにウイルスRNA転写開始点のゆらぎを生み出すHIV-1 RNAの構造的特性の解明を目的とした。鈴木は，フレームシフト阻害因子RyDENについて，その中央領域が抑制機能や共役因子PABPC1との相互作用に必要であることを見出した。次に，RyDEN，PABPC1，そして翻訳終結因子eRF3aの発現をそれぞれ減少させるとフレームシフト効率が高まったことから，RyDENはPABPC1とeRF3aから成る複合体の分子基盤となることでリボソームフレームシフトを制御する可能性が示された。また，フレームシフト効率を変化させる化合物として同定された17-AAGとNiclosamideは，HIV-1の感染性を低下させることがわかった。
小谷は，R/U5領域とフレームシフトエレメントの構造機能を制御する根幹部位の同定を目指した。今年度はAlphaFold3による構造予測をおこない，R/U5領域は各ステムループ構造の予測の精度は高いが，ミスマッチ塩基対が多く存在するthree-way junction構造は実験で決定した構造と異なることを示した。一方，フレームシフトエレメント構造は実験で決定した構造と類似しており，前後の塩基情報を含めるとフレームシフトエレメントを軸にvRNAが分岐する構造が予測された。
坂本は，表面プラズモン共鳴法によりアンチセンス核酸の候補と標的RNAとの相互作用を解析する系を確立した。標的RNAの結合部位が溶液に露出している際にアンチセンス核酸が結合できることから，今後はこの系を，リボソームフレームシフトを標的としたアンチセンス核酸のスクリーニングに用いる。また，逆転写酵素とインテグラーゼの融合タンパク質を調製し，核酸医薬候補との相互作用を解析する予定である。
芳田は，HIV-1の全長RNAの転写について，5’LTRのTATA-box下流のGGG配列の最初のGから開始されるものが一番多いものの，プロウイルスの鋳型となるRNAの大半は3番目のGから転写されたものであることを明らかにした。また，転写開始点を標的としたHIV複製抑制法についてのProof-of-Conceptを確立した。
河合は，転写反応をリアルタイムで解析する手法であるin NMR tube transcription法を基に，逆転写反応をリアルタイムで解析する手法としてin NMR tube reverse transcription法を開発した。HIV-1ゲノムRNAの5’UTRに由来するTARステムおよびPolyAステムの一部を含むRNAを鋳型とし，逆転写反応をNMR試料管中で行い，その過程をイミノプロトンシグナルの変化で確認できることを示した。また，特定のdNTPを加えなかったり，ddTTPを加えたりして逆転写反応を行うことによって反応の阻害を確認できることも示した。