申請者らは、長鎖シークエンス技術を用いてB型肝炎組織、B型肝炎肝癌のトランスクリプトームシークエンスを行った(AMED肝炎等克服実用化研究事業によって実施)。合計186例(肝癌 114例、非癌肝臓72例)を解析したところ、52997個のアイソフォーム(26217遺伝子)が検出された。癌部と非癌部肝臓の発現量を比較したところ、発現変動アイソフォームは11469個(発現上昇アイソフォームが7956個、発現低下アイソフォームが3513個)同定された。本研究では、この先行研究の結果に基づき、さらなる発見を目指して以下の3つの研究を行う。(1)同定したドライバーアイソフォーム候補(発癌や進展に寄与するアイソフォーム)の機能解析をさらに進め、創薬ターゲットの同定に繋げる。ドライバーアイソフォーム候補のノックダウンと過剰発現を行い、細胞増殖、遊走、浸潤に与える影響を評価する。発癌や癌の進展に関わるアイソフォームが得られた場合、阻害剤の探索を行う。(2)先行研究で解析したポリA型RNAに加えて非ポリA型RNAを含む全RNAの解析を行い、全RNAを対象として転写異常を包括的に明らかにする。さらに、(3)正常肝臓のトランスクリプトーム解析を行い、肝炎組織で生じている転写異常を解析する。