B型肝炎ウイルス(hepatitis B virus, HBV)の複製増殖および血中への放出は核酸アナログによる逆転写阻害により制御可能となったが、肝細胞内でのcccDNAあるいはintegrated DNAからのRNA転写、ウイルス蛋白産生は制御不能でありHBV克服の大きな課題である。特に最近、肝細胞内でHBV-RNAが多様なスプライシングを受け異常蛋白が発現、細胞障害・発癌に寄与していることが注目されているがその臨床的意義は明らかではない。これは従来のシークエンス技術ではHBVスプライシング変異体の解析が困難であることによる。 本研究では、申請者らの新規に構築した高精度1分子ロングリードシークエンス法によるHBV全ゲノムの1分子毎の直列塩基配列情報を用い、肝病態進展、薬剤抵抗性などにおける単一HBV全遺伝子変異ハプロタイプの意義を明らかとしてゆく。従来のシークエンス技術は検出困難なスプラインシグ変異体を含む未知変異に加え、第一、第二世代のシークエンス技術で個別に検討されてきたprecore変異、病態進展に伴って出現するpreS領域、発癌と関連するX領域欠失変異などの既知変異を単一のウイルスゲノム上の変異の組み合わせ(ハプロタイプ)として解析し、病態形成との関連を包括的に解明、診断・治療へ展開する。