申請者らは、PECAbs技術を適用したタンパク/RNA/DNAを対象とした三層空間プロテオゲノミクス解析のパイプラインをすでに構築している。三層空間プロテオゲノミクス解析は、細胞内構造や核内構造の検出が可能であることや翻訳後修飾の解析が可能であることに加えて、DNAや翻訳後修飾の検出が可能である点で、他の技術よりも優位である。B型肝炎ウイルスが肝細胞に感染すると、ウイルスDNAはcccDNAという形で細胞の核内に保存されたり、ヒトゲノムに組み込まれたりすることが知られている。また、拡散アナログ投与下においても、肝細胞内のcccDNAや挿入HBV-DNAから産生されるHBV抗原ペプチドによる肝臓組織の損傷、肝再生を繰り返すことで、線維化の進展や肝がんの発症につながる可能性がある。しかしながら、cccDNAやHBV挿入が発がんや再発に与えるメカニズムは明らかとなっていない。肝がんを発症した患者において、がんの再発や転移は大きな問題である。本研究では、肝がんや肝移植の組織検体の空間プロテオゲノミクス解析の画像データやこれまでに蓄積されている病理画像から特徴量を抽出し、再発や転移のリスクスコアを算出することや、肝がんや肝硬変の発症背景を予測することで、適切な患者管理や治療選択の実現を目指す。