タウオパチー患者由来のタウ線維によるシード依存性凝集の阻害については、培養細胞に患者脳由来のタウ線維を導入することで、タウの凝集を誘導するモデルに、様々なタウの欠損改変体を導入することでタウの凝集を阻害するタウ改変体を探索した。患者由来のタウ線維をシードとして線維形成を誘導する試験管モデル(RT-QUIC)や培養細胞モデルのタウ線維が患者脳のものと同じかどうかを調べることは重要であるため、クライオ電子顕微鏡による構造解析を実施する準備を行った。αシヌクレイン凝集阻害については、様々な改変αシヌクレインを発現するプラスミドを構築し、試験管モデル、細胞モデルで評価を行った。治療薬候補となる変異体について再現性を確認し、最適化を行った。TDP-43凝集阻害については、種々の改変体を発現するプラスミドを構築し、FTLD/ALS患者由来のTDP-43シードを添加して凝集誘導できる培養細胞系を構築した。分担研究者の本井は、4Rタウオパチー患者由来のタウ線維を導入してタウの蓄積を誘導する細胞モデルを用いて、その蓄積を抑制する改変タウを探索した。また、シード依存的な凝集が疾患特異的かについて、AD患者由来のタウ線維を用いた実験を並行して行い確認した。分担研究者の細川は、3Rタウだけを発現するマウスの増殖、系統維持を行った。また、そのマウスの脳にPick病患者由来のタウ線維を接種し、6ヶ月後のマウス脳においてタウ病理が検出されるかどうか観察した。分担研究者の吉田、齊藤、村山は、それぞれの施設での神経病理解析から、典型的な疾患病理を呈し、蓄積量の多い患者剖検脳を選別し、患者由来の異常型タンパク質を調製するために代表研究者に供与した。神経病理解析と患者凍結脳の提供を年間を通して行った。