JCOG プロトコール審査委員会によるフルプロトコール審査承認（令和2年12月）後に、JCOG肝胆膵グループ班会議においてキックオフを開催（令和3年1月）、臨床研究審査委員会（CRB）（国立研究開発法人国立がん研究センター中央病院臨床研究審査委員会）に研究計画書を提出し承認（令和3年2月）を受け、患者登録を開始した。本試験においては予定登録患者数300例（各群150例）、予定登録期間4年を見込んで登録を開始したが、登録開始後に本研究グループで実施した JCOG1202「根治切除後胆道癌に対する術後補助療法としてのS-1療法の第III相試験」の主たる解析の結果が明らかとなり、標準治療が手術単独から手術＋術後S-1療法となったことから、本試験の両群に術後S-1療法を追加するための改訂を行った。そのため、両群にS-1術後補助化学療法をプロトコール治療とすることによる上乗せを考慮した必要解析対象数は両群計330例（各群165例）となり、本改訂に伴う登録停止期間を考慮して登録期間は4年から5年に延長、追跡期間は変更前と同様、登録終了後3年、解析期間も変更前と同様１年とし、総研究期間は9年とした（令和2年12月改訂）。さらに、研究計画全体の予定を若干上回る速度で集積が進んでいるから検出力を70％から80％に変更することとし、若干の追跡不能例や事後不適格例を見込んで必要解析対象数を両群計460例（各群230例）とする改訂を行った（令和6年1月改訂）。令和7年4月18日時点で424例が登録されており、予定登録期間5年のままで、460例の登録完遂は可能と予想している。研究開発分担者は各々の研究計画書に基づき、本試験の開始に関する実務遂行、登録患者の診療に関するプロトコール記載の適正性に対する医学的責任、施設研究者からの質問への対応および参加施設の支援等の外科的観点（奈良聡）および内科的観点（井岡達也）からの包括的な実務、研究開発代表者はこれらの業務に対する管理・監督および参加施設への指導等を行った