岡本らのグループは、前年度までの研究でHIF-1がん細胞とCAFが構成する抵抗性ニッチの存在を明らかにしたが、臨床検体由来細胞の共培養系を用いてその機能的重要性の検証を行った。抗がん剤抵抗性ニッチ構成細胞であるCAFを手術検体より樹立した。次に、卵巣明細胞がん由来スフェロイドとの共培養により、Carboplatinに対する抵抗性が上昇する事を確認した。さらに、同じ臨床検体を用いたCodex解析を行なった所、抵抗性症例においてのみHIF-1陽性がん細胞および活性型CAFが構成する組織領域を確認した。このように、これまでのシングルセル解析とVisium解析の所見と一致するデータが得られた。今後は、細胞間相互作用により抗がん剤抵抗性を担う制御因子を機能的に同定する。
吉原らのグループは、これらの卵巣がん手術検体の取得および管理体制の整備、およびFFPE検体および凍結検体の採取を行った。また、Xenium解析に供する検体としての品質基準に適合する組織の選定、組織アレイ化の準備も進めた。加えて、取得した検体に関連する臨床情報の整理・データベース化を行い、解析結果との統合的な解釈が可能となる基盤を構築した。これにより、研究代表機関でのシングルセル空間的解析やCodex解析の実施において、解析精度と解釈の妥当性を高めることに寄与した。今後は、さらなる検体採取と情報更新を継続し、明細胞がんに特異的な治療抵抗性ニッチの解明を支援する予定である。
鈴木らのグループは、卵巣明細胞がんのFFPE検体を対象としたXenium解析を行った。これらのデータ解析は、岡本および吉原グループで継続中であるが、抵抗性症例におけるHIF-1陽性がん細胞の増加およびこれらの細胞周囲におけるCAF領域の存在を確認しており、これまでのVisium解析およびCodex解析と整合性のとれた知見が得られつつある。
後藤らのグループは、これまでの研究でトリプルネガティブ乳がん患者由来のCAFとがんスフェロイドの共培養系を確立し、CAF由来のGCSFががん細胞特性および骨転移能を誘導する事を見出している。そこで、卵巣がんで発見された治療抵抗性領域のフィードバック制御機構が、乳がんにも存在するか、乳がん患者由来細胞やPDXモデルを用いて解析した。その結果、GCSF-CXCL12という、卵巣がんとは異なるサイトカインが担う相互制御機構の存在を確認した。