再発小児がんの多様性に立脚した新規克服法の開発
研究課題情報
- 課題管理番号
- 25ama221531h0002
- 統合プロジェクト(三期)
医薬品プロジェクト
- 統合プロジェクト(二期)
医薬品プロジェクト<第二期>
- 事業名
次世代がん医療加速化研究事業
- タグ(2025)
研究開発目的: 治療に関する研究
研究の性格: 医薬品開発<新規化合物>
研究モダリティ: 中分子医薬品-ペプチド
開発フェーズ: 基礎
ICD-10大分類: 新生物<腫瘍>
対象疾患領域: がん , 難病 , 成育 , その他
特記的事項: 研究倫理<ELSI/RRI等>
補足確認: 診断 , 治療 , 予後・生活の質<QOL>
- タグ(2024)
研究開発目的: 治療に関する研究
研究の性格: 医薬品開発<新規化合物>
研究モダリティ: 中分子医薬品-ペプチド
開発フェーズ: 基礎
ICD-10大分類: 新生物<腫瘍>
対象疾患領域: がん , 難病 , 成育 , その他
特記的事項: 研究倫理<ELSI/RRI等>
補足確認: 診断 , 治療 , 予後・生活の質<QOL>
- 代表研究機関
- 国立大学法人京都大学
- 研究代表者
(2025) 滝田順子, 国立大学法人京都大学, 大学院医学研究科 発達小児科学 教授
(2024) 滝田順子, 国立大学法人京都大学, 大学院医学研究科 発達小児科学 教授
- 研究期間
- 2024年度 - 2025年度
- 課題への総配分額
- 55,900 千円
- 研究概要(2025)
- 本研究では、これまで解決が困難であった再発小児がんの克服のために、小児がんで最も頻度が高い急性白血病と再発率が極めて高い神経芽腫を対象に、これまで見出した研究シーズを基盤として、融合オミクス解析を展開する。出口目標としては、「遺伝子変異を標的とする治療」においては、既存の分子標的薬の適応拡大、小児がんを対象とした、疾患横断的なアンブレラ・バスケット試験の立案および導出、また「遺伝子変異によらない治療」においては、miRNAを標的とした治療開発の基盤構築ならびにバイオマーカーとしての有用性の検証、がん代謝を標的とした新規治療法の提案とする。これらの異種の治療を双方向性に組み合わせることで、最適な新規治療スキームの提案を試みる。今年度は、再発T-ALLの予後不良サブグループの分子機序の検討を行い、また高リスク神経芽腫における標的遺伝子群の同定、新規治療法の開発を推進する。さらにPDXマウスモデルの樹立とPDX細胞の性状解析を終了する。
- 研究概要(2024)
- 本研究では、これまで解決が困難であった再発小児がんの克服のために、小児がんで最も頻度が高い急性白血病と再発率が極めて高い神経芽腫を対象に、これまで見出した研究シーズを基盤として、融合オミクス解析を展開する。出口目標としては、「遺伝子変異を標的とする治療」においては、既存の分子標的薬の適応拡大、小児がんを対象とした、疾患横断的なアンブレラ・バスケット試験の立案および導出、また「遺伝子変異によらない治療」においては、miRNAを標的とした治療開発の基盤構築ならびにバイオマーカーとしての有用性の検証、がん代謝を標的とした新規治療法の提案とする。これらの異種の治療を双方向性に組み合わせることで、最適な新規治療スキームの提案を試みる。今年度は、再発BCP-ALLに特徴的なmiRNA群の病的意義の検討を行い、また再発神経芽腫における網羅的メチル化解析とセリン代謝を促進する遺伝子群の同定、分類不能/最未分化白血病の統合的ゲノム・エピゲノム全体像の解明を終了する。さらにPDXマウスモデルの樹立とPDX細胞の性状解析を終了する。
研究成果情報
2024
成果の概要
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再発・難治がんにおける発症分子機構に立脚した合理的かつ本質的な新規克服法の開発を目指して、多層的オミックス解析を展開し、今年度は以下の成果を得た。
1) 再発白血病に特徴的なmiRNA群を標的とした新規克服法の開発とバイオマーカーとしての有用性の検証
再発・難治の小児T細胞性急性リンパ性白血病(T-ALL)におけるmiRNAの発現プロファイルを明らかにし、有用なバイオマーカーを同定するために、JCCG ALL T11臨床試験に登録された40例の保存検体を用いて、miRNAシーケンス、全ゲノム解析、RNAシーケンスを実施した。その結果、再発例に特徴的なmiRNAプロファイルを同定し、サブタイプや遺伝子変異との関連を検討している。有用なmiRNAに関しては、さらに症例数を増やした検証を行う。
2) 再発神経芽腫におけるセリン代謝を基軸とした新規治療法の開発
再発神経芽腫に対しがん代謝の性質に着目した新規治療戦略を創出することを目的とし公開データ解析ならびに自験例230例の解析を行った。具体的には、抗がん剤治療後におけるがん細胞の性質の変化・傾向を観察する目的で、再発難治例および初発時と化学療法後のペアの発現データセットの解析を開始し、治療後においてもがん代謝のパターンがある程度保たれていることを確認した。
3) 既存の分子標的薬の適応拡大を目指した多様性の全容解明
高リスク神経芽腫における新規治療標的の有用性を検証するために肺小細胞がんに対する既存の二重性特異的抗体の有用性を検証するための基礎的検討を実施した。自験例の神経芽腫60例の標的遺伝子XXの免疫染色ならびにRNAシーケンス、全エクソンシーケンス(WES)を実施した。その結果、XX遺伝子は高リスク・再発神経芽腫に高発現しており、無病生存率、MYCN増幅と有意な関連を持つことが判明した。
4)ヒト化マウスモデルによるクローン進化の解明と新規治療法の開発
高リスク神経芽腫、再発ALL、AMLの臨床検体計12検体をNOGマウスに移植し、生着を確認した。樹立したPDX細胞の性状をRNAシーケンス、WESおよぼメチル化解析を実施した。またEBウイルス関連腫瘍のPDXマウスを樹立し、薬剤抵抗性の検証を行った。
1) 再発白血病に特徴的なmiRNA群を標的とした新規克服法の開発とバイオマーカーとしての有用性の検証
再発・難治の小児T細胞性急性リンパ性白血病(T-ALL)におけるmiRNAの発現プロファイルを明らかにし、有用なバイオマーカーを同定するために、JCCG ALL T11臨床試験に登録された40例の保存検体を用いて、miRNAシーケンス、全ゲノム解析、RNAシーケンスを実施した。その結果、再発例に特徴的なmiRNAプロファイルを同定し、サブタイプや遺伝子変異との関連を検討している。有用なmiRNAに関しては、さらに症例数を増やした検証を行う。
2) 再発神経芽腫におけるセリン代謝を基軸とした新規治療法の開発
再発神経芽腫に対しがん代謝の性質に着目した新規治療戦略を創出することを目的とし公開データ解析ならびに自験例230例の解析を行った。具体的には、抗がん剤治療後におけるがん細胞の性質の変化・傾向を観察する目的で、再発難治例および初発時と化学療法後のペアの発現データセットの解析を開始し、治療後においてもがん代謝のパターンがある程度保たれていることを確認した。
3) 既存の分子標的薬の適応拡大を目指した多様性の全容解明
高リスク神経芽腫における新規治療標的の有用性を検証するために肺小細胞がんに対する既存の二重性特異的抗体の有用性を検証するための基礎的検討を実施した。自験例の神経芽腫60例の標的遺伝子XXの免疫染色ならびにRNAシーケンス、全エクソンシーケンス(WES)を実施した。その結果、XX遺伝子は高リスク・再発神経芽腫に高発現しており、無病生存率、MYCN増幅と有意な関連を持つことが判明した。
4)ヒト化マウスモデルによるクローン進化の解明と新規治療法の開発
高リスク神経芽腫、再発ALL、AMLの臨床検体計12検体をNOGマウスに移植し、生着を確認した。樹立したPDX細胞の性状をRNAシーケンス、WESおよぼメチル化解析を実施した。またEBウイルス関連腫瘍のPDXマウスを樹立し、薬剤抵抗性の検証を行った。
学会誌・雑誌等における論文一覧
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1. Isobe K, Saida S, Honda Y, Nihira H, Hiejima E, Izawa K, Kubota H, Kato I, Umeda K, Hiramatsu H, Yasumi T, Takita J.Successful cord blood transplantation using reduced intensity conditioning in a 5-month-old patient with IL-10RA deficiency.Pediatr Blood Cancer. 2024 Aug;71(8):e31056. doi: 10.1002/pbc.31056. Epub 2024 May 9.PMID: 38721857
2. Kimura S, Park CS, Montefiori LE, Iacobucci I, Pölönen P, Gao Q, Arnold ED, Attarbaschi A, Brown A, Buldini B, Caldwell KJ, Chang Y, Chen C, Cheng C, Cheng Z, Choi J, Conter V, Crews KR, de Groot-Kruseman HA, Deguchi T, Eguchi M, Muhle HE, Elitzur S, Escherich G, Freeman BB 3rd, Gu Z, Han K, Horibe K, Imamura T, Jeha S, Kato M, Chiew KH, Khan T, Kicinski M, Köhrer S, Kornblau SM, Kotecha RS, Li CK, Liu YC, Locatelli F, Luger SM, Paietta EM, Manabe A, Marquart HV, Masetti R, Maybury M, Mazilier P, Meijerink JPP, Mitchell S, Miyamura T, Moore AS, Oshima K, Pawinska-Wasikowska K, Pieters R, Prater MS, Pruett-Miller SM, Pui CH, Qu C, Reiterova M, Reyes N, Roberts KG, Rowe JM, Sato A, Schmiegelow K, Schrappe M, Shen S, Skoczeń S, Spinelli O, Stary J, Svaton M, Takagi M, Takita J, Tang Y, Teachey DT, Thomas PG, Tomizawa D, Trka J, Varotto E, Vincent TL, Yang JJ, Yeoh AEJ, Zhou Y, Zimmermann M, Inaba H, Mullighan CG. Biologic and Clinical Analysis of Childhood Gamma Delta T-ALL Identifies LMO2/STAG2 Rearrangements as Extremely High Risk.Cancer Discov. 2024 Oct 4;14(10):1838-1859. doi: 10.1158/2159-8290.CD-23-1452.PMID: 38916500
3. Yano N, Chong PF, Kojima KK, Miyoshi T, Luqman-Fatah A, Kimura Y, Kora K, Kayaki T, Maizuru K, Hayashi T, Yokoyama A, Ajiro M, Hagiwara M, Kondo T, Kira R, Takita J, Yoshida T. Long-read sequencing identifies an SVA_D retrotransposon insertion deep within the intron of ATP7A as a novel cause of occipital horn syndrome.J Med Genet. 2024 Sep 24;61(10):950-958. doi: 10.1136/jmg-2024-110056.PMID: 38960580
4. Uchihara Y, Umeda K, Yamada Y, Ito H, Tasaka K, Isobe K, Akazawa R, Kawabata N, Saida S, Kato I, Hiramatsu H, Noguchi T, Sakamoto A, Arakawa Y, Arakawa A, Yamamoto N, Hosoya Y, Uemura S, Watanabe KI, Sano H, Taga T, Takita J.MGMT protein expression is a reliable predictive biomarker for temozolomide-containing chemotherapy in osteosarcoma.Cancer Sci. 2024 Oct;115(10):3394-3402. doi: 10.1111/cas.16297. Epub 2024 Jul 30.PMID: 39080996
5. Pölönen P, Di Giacomo D, Seffernick AE, Elsayed A, Kimura S, Benini F, Montefiori LE, Wood BL, Xu J, Chen C, Cheng Z, Newman H, Myers J, Iacobucci I, Li E, Sussman J, Hedges D, Hui Y, Diorio C, Uppuluri L, Frank D, Fan Y, Chang Y, Meshinchi S, Ries R, Shraim R, Li A, Bernt KM, Devidas M, Winter SS, Dunsmore KP, Inaba H, Carroll WL, Ramirez NC, Phillips AH, Kriwacki RW, Yang JJ, Vincent TL, Zhao Y, Ghate PS, Wang J, Reilly C, Zhou X, Sanders MA, Takita J, Kato M, Takasugi N, Chang BH, Press RD, Loh M, Rampersaud E, Raetz E, Hunger SP, Tan K, Chang TC, Wu G, Pounds SB, Mullighan CG, Teachey DT. The genomic basis of childhood T-lineage acute lymphoblastic leukaemia. Nature. 2024 Aug;632(8027):1082-1091. doi: 10.1038/s41586-024-07807-0. Epub 2024 Aug 14.PMID: 39143224
6. Kato S, Tsujimoto SI, Matsubayashi J, Iwamoto S, Hiramatsu H, Okuno Y, Kamitori T, Ohki K, Deguchi T, Kiyokawa N, Kato M, Takita J, Tanaka S, Adachi S, Tomizawa D, Shiba N. Adverse prognostic impact of KIT exon 17 mutations despite negative flow cytometric measurable residual disease in pediatric acute myeloid leukemia with RUNX1::RUNX1T1. Haematologica. 2024 Sep 5. doi: 10.3324/haematol.2024.286243. Online ahead of print.PMID: 39234860
7. Akita M, Tomotaki S, Hanaoka S, Araki R, Motokura K, Tomobe Y, Tomotaki H, Iwanaga K, Takita J, Kawai M. Pathophysiology of Hyponatremia in Preterm Infants with Relative Adrenal Insufficiency after the Early Neonatal Period.Am J Perinatol. 2024 Sep 30. doi: 10.1055/a-2413-0844. Online ahead of print.PMID: 39260413
8. Kato K, Goto H, Tanaka M, Suzuki T, Toyoda Y, Shinkai M, Kitagawa N, Nishi T, Kigasawa H, Kurosawa K, Aida N, Yoshimi A, Noda A, Ito Y, Seki M, Takita J, Nagahara N, Tsuchida M, Tanaka Y. Establishment and Characterization of a Novel Pleuropulmonary Blastoma Cell Line.Genes Chromosomes Cancer. 2024 Oct;63(10):e23276. doi: 10.1002/gcc.23276.PMID: 39400393
9. Kato I, Tomizawa D, Kato M, Hirabayashi S, Manabe A, Irie M, Sasahara Y, Arakawa Y, Koh K, Sakaguchi H, Sugiyama M, Ogawa C, Kamiya T, Saito S, Nakazawa Y, Nishio N, Takahashi Y, Iwai N, Adachi S, Takita J, Miyamura T, Yokoyama S, Oba U, Ueda T, Koga Y, Hiramatsu H. Real-world Outcomes of Commercial Tisagenlecleucel for Children, Adolescents, and Young Adults With Acute Lymphoblastic Leukemia in Japan. Transplant Cell Ther. 2025 Feb;31(2):86-96. doi: 10.1016/j.jtct.2024.11.016. Epub 2024 Nov 30.PMID: 39617098
10. Noguchi M, Yamasaki K, Azuma S, Kikuchi N, Nitani C, Okada K, Kiyokawa N, Isobe K, Takita J, Fujisaki H, Hara J. Long-term remission achieved with allogeneic hematopoietic stem cell transplantation at first complete remission in a pediatric patient with TCF7::SPI1 fusion-positive T-cell acute lymphoblastic leukemia. Rinsho Ketsueki. 2025;66(1):49-53. doi: 10.11406/rinketsu.66.49.PMID: 39924208
学会・シンポジウム等における口頭・ポスター
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1. 新生児と乳児の白血病 KMT2A再構成陽性乳児急性リンパ性白血病の分子病態の解明. 滝田順子. シンポジウム 第34回日本産婦人科・新生児血液学会 学術集会 2024/6/7-8. 国内 口頭
国内 / 口頭
2. C19MC miRNAsの過剰発現およびTP53変異の段階的な集積が肝未分化肉腫発症に関与する. 内原 嘉仁、梅田 雄嗣、田坂 佳資、三上 貴司、才田 聡、加藤格、平松 英文、山田 洋介、垣内 伸之、田中 祐吉、大喜多 肇、義岡 孝子、瀧本 哲也、檜山 英三、小川 誠司、滝田 順子. 第83回日本癌学会学術総会 2024/9/19-21. 国内 口頭
国内 / 口頭
3. ゲノムから探る造血器腫瘍の分子病態 小児造血器腫瘍における分子病態の解明. 滝田 順子 シンポジウム 第83回日本癌学会学術総会 2024/9/19-21. 国内 口頭
国内 / 口頭
4. CyTOF®機械学習を用いた解析は急性骨髄性白血病における微小残存病変の診断精度を改善しうる. 幸伏 寛和、三上 貴司、平松 英文、岩井 篤、加藤 格、滝田 順子. 第83回日本癌学会学術総会 2024/9/19-21. 国内 ポスター
国内 / ポスター
5. AMLにおけるFLT3-ITDとCCND3変異の共存に伴う予後不良と薬剤耐性化 庄子 皓太, 吉田 健一, 伊与田 真寿, 田中 美羽, 石川 百恵, 野邊 道大, 河下 咲紀, 南谷 泰仁, 大和 玄季, 辻本 信一, 柴 徳生, 林 泰秀, 白石 友一, 宮野 悟, 清河 信敬, 富澤 大輔, 多賀 崇, 多和 昭雄, 滝田 順子, 錦織 桃子, 足立 壯一, 小川 誠司, 松尾 英将, 第86回日本血液学会 2024/10/11-13、国内 口頭
国内 / 口頭
6. 最新次世代NOGマウスを使用した急性骨髄性白血病のPDXモデル作成 宮原 由佳, 三上 貴司, 加藤 格, 赤澤 嶺, 安積 昌平, 片野 いくみ, 伊藤 亮治, 錦織 桃子, 伊藤 守, 滝田 順子 第86回日本血液学会 2024/10/11-13、国内 口頭
国内 / 口頭
7. 女性患者における造血細胞移植後の妊娠の詳細調査 藤井 伸治, 福田 隆浩, 蘆澤 正弘, 清谷 知賀子, 豊崎 誠子, 前田 尚子, 神田 善伸, 藤原 慎一郎, 西田 徹也, 渡邉 健一郎, 高橋 義行, 滝田 順子, 片山 雄太, 河北 敏郎, 大引 真理恵, 熱田 由子, 稲本 賢弘 女性患者における造血細胞移植後の妊娠の詳細調査 第86回日本血液学会 2024/10/11-13、国内 口頭
国内 / 口頭
8. FormsNet3を用いた本邦におけるALLに対するCAR-T療法のリアルワールド解析 加藤 格,城 友泰, 滝田 順子, 古賀 友紀, 土岐 典子, 康 勝好, 北脇 年雄, 山内 拓司, 高橋 義行, 大曽根 眞也, 柴 徳生, 森尾 友宏, 田渕 健, 熱田 由子, 加藤 光次 第86回日本血液学会 2024/10/11-13、国内 口頭
国内 / 口頭
9. CYTOFと機械学習を用いた急性骨髄性白血病微小残存病変の新たな解析法の確立幸伏 寛和(京都大学 大学院医学研究科発達小児科学), 三上 貴司, 平松 英文, 岩井 篤, 加藤 格, 滝田 順子 第86回日本血液学会 2024/10/11-13、国内 口頭
国内 / 口頭
10. 骨髄移植を実施した幼児期患児と同胞ドナーへの心理社会的介入 上山 美津穂, 加藤 格,岩井 直子,平松 英文,滝田 順子,小野原 明子 第66回日本小児血液・がん学会 2024/12/13-15 国内 口頭
国内 / 口頭
「国民との科学・技術対話社会」に対する取り組み
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1. 滝田順子,子供のがんを深く知る 京都大学エグゼクティブ・リーダーシップ・プログラム 講義 2024/5/25, 国内
国内
2. 滝田順子,小児がんに対する優しい新たな治療法を目指して AMEDがんシンポジウム しるxしるxみちる ~がんの研究のこれまでとこれから~ 2024/6/15, 国内
国内
3. 窪田博仁, 滝田順子, 小児がんにおける"がんゲノム医療"の最前線 第66回日本小児血液・がん学会学術集会 市民公開講座 2024/12/13-15, 国内
国内