がんの発生母地となっていると考えられる体細胞モザイクから発がんに至る過程の解析を行っている。
体細胞モザイクの解析では、胆膵および泌尿器の正常組織、前癌病変及びがんについて手術検体から、多数の微小サンプルを採取し、全エクソン解析や全ゲノム解析を行い、体細胞変異の網羅的な解析により、クローン拡大の解析を進めている。クローン進化のメカニズムの解析では単一細胞レベルでの変異とエピゲノム（クロマチンアクセシビリティ）の同時開発の系を進めるとともに、腎臓のクローン進展の解析で見いだしたゲノム異常を解析する単一核・細胞解析の系の開発を進めている。早期診断技術の開発では、Duplexシーケンスにより微小クローンを同定可能としたが、現在さらにエラー率の低いNanoseqの応用を進めている。
また、膵胆管上皮、尿路上皮の体細胞モザイクについて、同定されたドライバー変異について早期介入の標的となりうる変異の同定を行う。加えて化合物ライブラリーを用いた治療介入ストラテジーの確立を試みている。早期介入のための解析モデルの開発のため、患者検体からオルガノイドを樹立し、全ゲノム解析を行うとともに、不死化正常上皮細胞株を用いた遺伝子変異を有するモデル作成も複数株完了させた。これら作成したモデル群について、今後は化合物ライブラリーを用いたin vitro増殖阻害効果検証を実施する。