近年、ゲノム解析技術の進歩によりdriver mutationが同定され、分子標的薬の臨床応用が進んでいる。しかし治療効果は一過性にとどまり、多くの症例で再増悪がみられる。特にresistant mutationが検出されないまま耐性を示すdrug-tolerant persister（DTP）細胞は、新たな課題として注目されている。 本研究開発は、がん領域と非がん呼吸器再生医学を横断する“異分野融合”型プロジェクトである。具体的には、ヒトiPS細胞由来肺胞オルガノイド（三次元肺ニッチ, HiLung社協力）とdriver mutation保有肺がんオルガノイドを融合させ、「がん細胞単独」ではなく非がん細胞を含む“がん組織＝異常リモデリング”として肺がんを解析・制御する新しい創薬パラダイムを創出する。さらにscRNAseqおよびXeniumによる時系列Multi-omics Profilingを適用し、細胞系譜、リガンド–レセプター相互作用、細胞外マトリクス再構築の連鎖的変化を一細胞レベルで解明し、代表者のAMED創薬基盤推進研究で得られた肺異常リモデリングの知見を統合して解析する。