（１） 新規分子標的SHMT2のPOC取得
トリプルネガティブ乳がんHCC38と患者由来がん細胞を用いて、Doxycyclin (DOX)誘導的にSHMT2をノックアウトする細胞を樹立した。DOX誘導的SHMT2ノックアウトにより細胞増殖が抑制、さらにギ酸を培地中に加えることによって細胞増殖の抑制がレスキューされることを確認し、SHMT2特異的ノックアウトによる効果を確認できた。
（２） SHMT2阻害剤の開発
支援班との打ち合わせを行った結果、支援を受けることが承認された（令和７年５月１４日）。
既知のSHMT2結晶構造を基盤としたドッキングシミュレーションとバーチャルスクリーニング手法の初期段階として、GPUを活用した高速ドッキングシミュレーションにより、約5千万化合物に対する予備的なスクリーニングを実施した。この大規模計算により、潜在的なSHMT2阻害剤候補の初期評価が可能となった。しかしながら、ドッキングシミュレーションから得られるスコア値のみでは、活性化合物を化合物ライブラリーから効果的に濃縮することが困難であった。現在は、SHMT2と阻害剤の複合体の立体構造解析から得られた相互作用メカニズムの情報を組み込むアプローチを検討している。評価用データセットとしては、ChEMBLなどの公共データベースからSHMT2阻害剤の活性情報を収集し、設計したスコア関数が実際に活性化合物をデコイから効率よく識別できるかを検証している。
（３） 乳がんオルガノイドライブラリーの作製とがんオルガノイド３次元イメージングによるヒット化合物評価系の構築
金沢大学乳腺外科との共同研究により、乳がんの組織検体を術中に供与いただき、オルガノイド培養、PDX構築を行っている。本年度は新たに16検体のオルガノイド、PDX構築を行った。
がんオルガノイド・がんスフェロイド、マトリゲル内に封入培養されたがんオルガノイドに対する、組織透明化および３次元組織染色の主要パラメータの最適化に取り組み、多様な培養方法・乳がんオルガノイド種への適用を可能とするワークフローの汎用化・最適改変を目指した。がんスフェロイド試料を1細胞解像度で３次元撮像するPOCの取得に成功しており、この結果をもとに、光学系パラメータの容易な調整を実現する操作基盤インターフェイス（ソフトウェア）の開発を進めている。加えて、多検体のハイスループット３次元イメージングに特化したライトシート顕微鏡として発売されたCYTOQUBE（浜松ホトニクス）が稼働する環境を構築した。