近年、染色体外で環状になったDNA（染色体外環状DNA, eccDNA）ががん細胞で広範に存在することが報告され、がんの進化、不均一性、薬剤耐性に関係することなどから徐々に注目を集めている。染色体外環状DNAは、がん遺伝子とエンハンサーを含みがん遺伝子を強く転写活性化するため、正常細胞ではみられないこととあわせて、より選択的な転写・エピゲノム標的治療法の標的となると考えられる。本研究では、染色体外環状DNA を有するがん細胞における生存必須遺伝子のスクリーニングを通じて、染色体外環状DNAを標的としたより特異性の高い転写・エピゲノム標的治療法を開発することを目的としている。
令和6年度では、令和5年度に引き続き、染色体外環状DNAを有するがん細胞株における生存必須遺伝子のin vitroでの検証、分子メカニズムに関するイメージング解析・マルチオミクス解析を実施した。さらに、新たに同定された染色体外環状DNAハイコピー細胞株に有効な薬剤候補についても、in vitroでの検証、分子メカニズムに関するイメージング解析・マルチオミクス解析を実施した。令和7年度では、シングルセル解析などを含めた治療標的としての検証を進めていく予定である。