令和6年は26件の支援を完了し、9件を支援中であり、年度当初の支援予定数を上回り、前年度を超える支援を実施した。昨年度と同様にセクレトーム解析やエクソソーム解析は相当数の支援を実施したが、加えてタンパク質複合体のクロスリンク解析、動物に投与した合成タンパク質の血中濃度の測定、精製タンパク質のアミノ酸配列の決定、パラフィン包埋(FFPE)切片のプロテオーム解析など単純なプロテオーム解析では対応できない特殊なプロテーム解析が増加した。また、9月に増田が異動により分担者から外れたが、微量プロテオーム解析は大槻が担当して実施し、すでに1件を完了した。高度化に関しては、難溶性タンパク質試料のタンパク質抽出を化学的消化と高圧力処理に行う技術を開発し、従来法よりも短時間で効率よくタンパク質を抽出し、プロテオーム解析を行うことが可能となった。また、被支援者側によるプロテオミクスデータ解析を可能とするためのwebアプリの開発に取り組み、RNAseqChefで、プロテオーム情報のフォーマットへの対応を含めたさまざまな改良を行い、実支援での利用を開始した。加えて、支援に対応するためにクロスリンクプローム解析やde novo解析のソフトウェア導入と比較検討を実施し、支援に用いた。また、解析スループット向上を目指し、質量分析システムのバージョンアップを行い、セットアップを完了した。次年度にアップグレードシステムを用い、スループットの向上の高度化を実施する。微量・１細胞プロテオーム解析については、昨年度開発したシステムを用い、2000細胞の1細胞プロテオミクスを実施し、データを得ることに成功した。膨大なプロテオームデータのデータ処理の評価、検討を実施して最適化することにより、細胞周期に従って変動するタンパク質を1細胞レベルで解析することができた。