令和6年度は、領域内での連携を活用して提供いただいた疾患患者由来の糞便を対象としたMV解析を重点的に行った。MV産生と関連性の高い対象疾患として炎症性腸疾患に着目し、同患者糞便由来のMV-DNAの解析を実施することで、疾患患者で総体的な産生量を増加・減少させるMV産生菌の同定を行った。精製したMVに対して１粒子DNA解析を実施したところ、健常者、患者に関わらず広く検出される細菌群の存在が明らかになった他、各疾患患者サンプルにおいて特異的に検出される細菌群も見出された。また、糞便あたりの検出MV数を比較したところ、健常者由来の糞便に比べて平均的なMV量が増加する傾向が明らかとなった。腸内環境の変動と死菌数の関連については報告例があり、こうした細胞死の増加に関連する検出MV量の増大を実サンプルにおいても捉えることができたことで、対象疾患とMVの関連性を強く裏付ける結果と考えている。
また、MV内包DNAの生態学的意義を調べるため、病原菌由来のMVを対象として、内包DNA領域が進化の過程で他の細菌へと遺伝子水平伝播により広まった可能性について検証を行った。病原菌が属する細菌グループに対して比較ゲノム解析を実施したところ、MV内包DNA領域が水平伝播によって獲得されたと考えられるケースが複数存在することが明らかとなり、MVが水平伝播の媒介因子としての役割を持ち得る可能性が示唆された。
またターゲットとする病原菌に対して薬剤を添加することで、主要なMV産生経路を人為的に変化させたところ、細胞膜変形（blebbing）による産生のケースと比較して、細胞死によってMVが産生されるケースではゲノム上の特定領域の内包が起こりにくくなることが明らかとなった。この結果は、MVへのDNA内包が特定のメカニズムと連動して能動的に生じていることを強く示唆する結果であると考えている。