本研究課題では、認知症や神経変性疾患研究において世界的に注目されている「神経炎症」に着目し、その病態メカニズム解明と制御法の開発を通じて、これらの疾患の治療シーズ開拓を目指す。空間的遺伝子発現解析技術を用いたアルツハイマー病（AD）マウスおよびAD死後脳の統合解析による神経炎症病態の理解に資する新たな４次元分子カタログの樹立と神経炎症を標的とする新たな治療シーズの開拓を目指す。ADマウスの前臨床試験に資するヒト臨床により近い改良版認知行動機能検査法を開発する。さらに、ヒトにおける神経炎症の評価系として、ヒトミクログリア様細胞（iMG）培養系を樹立・解析することを目標とする。最終年となる令和６年度は、以下の進捗が見られた。
AppNL-G-Fマウス脳におけるVisium空間的遺伝子発現解析と機械学習を組み合わせた新しいアプローチにより、各遺伝子のAβ凝集形成への寄与度を示す重み係数を得ることができ、Aβ近傍で変動する遺伝子の順位付けをすることができた。論文投稿に向けて研究結果を取りまとめた。ADにおける神経炎症制御因子CB2による神経保護機構の解明について、AppNL-G-FマウスにCB2作動剤を投与し、神経炎症および空間および物体認知機能の改善を認めたことからそのメカニズムも含めて研究成果を取り纏めて論文発表した。MACS法を用いたAppNL-G-F;IFITM3KOマウスの皮質内グリア細胞における遺伝子解析結果から、IFITM3の発現の有無はAppNL-G-Fマウスのミクログリア貪食能や、アストログリアのサイトカイン発現に影響する可能性を見つけた。一方、rTg4510マウスの皮質における単離グリア細胞における遺伝子発現変化と行動異常との関係性から、rTg4510マウスの特徴を抽出し、論文投稿した。iMG細胞でP2RY12、GPR34、PROS1等のミクログリア関連遺伝子発現を確認できていたが、追加解析によりヒト脳ミクログリアでの発現遺伝子の多くについてもiMG細胞で発現していることを明らかにした。AD患者検体からiMG細胞誘導を行い、RNA-seqで健常群との遺伝子発現比較解析を行った。