令和5年度に得られたターゲット分子と化合物との複合体の立体構造情報に基づいて、１）分子動力学（MD）シミュレーションならびにドッキングシミュレーション、２）量子化学計算を実施した。これらの計算で得られたターゲット分子内の特定のアミノ酸と化合物との相互作用情報ならびに、化合物のターゲット分子への反応性情報を考慮した化合物の構造デザインを行った。加えて、３）生成系AIを用いて化合物のin vitro活性・物性改善のための化合物のデザイン・構造発生についても同時並行で実施した。１）～３）のデザイン化合物をプロジェクトチーム内あるいは外注にて合成し、in vitro活性評価を行った。その結果、出発化合物と同等の活性、物性を示す化合物は得られたが、活性・物性が顕著に向上した化合物の同定には至らなかった。また、化合物の作用機序情報を化合物の合成展開に活用することを目的として、ターゲット分子単体構造と化合物との複合体構造を、ターゲット分子の類縁体分子の単体構造と化合物との複合体構造と原子レベルで比較・解析した。その結果、化合物の主活性の作用機序であるターゲット分子のアロステリック構造変化誘発のメカニズムの詳細が明らかになり、本プロジェクト化合物合成展開における難易度の一因を解明することができた。