研究課題情報
課題管理番号
24kk0305020h0003
統合プロジェクト(二期)

ゲノム・データ基盤プロジェクト<第二期>

事業名

ゲノム創薬基盤推進研究事業

タグ(2024)

研究開発目的: 診断に関する研究

研究の性格: 新規診断法・検査法・検査体制の開発、確立、検証等を目指す研究

研究モダリティ: 新規診断法

ICD-10大分類: 新生物<腫瘍>

対象疾患領域: がん

補足確認: 診断

タグ(2023)

研究開発目的: 診断に関する研究

研究の性格: 新規診断法・検査法・検査体制の開発、確立、検証等を目指す研究

研究モダリティ: 新規診断法

ICD-10大分類: 新生物<腫瘍>

対象疾患領域: がん ,  難病

特記的事項: 研究倫理<ELSI/RRI等>

補足確認: 予防・保健 ,  診断 ,  治療

タグ(2022)

研究の性格: 新規診断法・検査法・検査体制の開発、確立、検証<診断薬・診断機器開発は除く>

開発フェーズ: 該当なし

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: その他

疾患領域: がん

開発目的: 診断

代表研究機関
国立大学法人岡山大学
研究代表者

(2024) 細野祥之, 国立大学法人岡山大学, 学術研究院医歯薬学域 薬理学分野 教授

(2023) 細野祥之, 国立大学法人岡山大学, 学術研究院医歯薬学域 薬理学分野 教授

(2022) 細野祥之, 国立大学法人岡山大学, 学術研究院医歯薬学域 薬理学分野 教授

研究期間
2022年度 - 2024年度
課題への総配分額
110,500 千円
研究概要(2024)
以下(1)~(4)について遺伝性腫瘍に見られるVUSのin vivo機能的アノテーションを行い、中杤らによるin silico機能的アノテーションの結果と統合する。(1)BRCA1/2に見られるVUSに対する、多次元機能的アノテーション(①バリアントをまとめて、②バリアントを個々に)(2)DDR遺伝子群に見られるVUSの組み合わせに対する、多次元機能的アノテーション(②バリアントを個々に)(3)TP53に見られるVUSに対する、多次元機能的アノテーション(①バリアントをまとめて)(4)家族性の集積を認めるが、遺伝子変異が見いだせなかった症例に対する、全トランスクリプト移植法を用いた網羅的なバリアント探索さらに(1)、(2)、(3)に関しては、in vitroハイスループットスクリーニングも施行し、in vivo、in silicoの結果と統合し、バリアントの最終判定を行う。中央西日本遺伝性腫瘍コホート研究におけるVUSに関しては、機能的な予測情報も含めて米国・ゲノム変異情報データベース (ClinVar)へ情報提供し、実臨床例に対しては病原性推定結果のsegregationデータを取り、実臨床への返還にも努める。
研究概要(2023)
 以下(1)~(4)について遺伝性腫瘍に見られるVUSのin vivo機能的アノテーションを行い、中杤らによるin silico機能的アノテーションの結果と統合する。 (1)BRCA1/2に見られるVUSに対する、多次元機能的アノテーション((1)バリアントをまとめて、(2)バリアントを個々に) (2)DDR遺伝子群に見られるVUSの組み合わせに対する、多次元機能的アノテーション((2)バリアントを個々に) (3)TP53に見られるVUSに対する、多次元機能的アノテーション((1)バリアントをまとめて) (4)家族性の集積を認めるが、遺伝子変異が見いだせなかった症例に対する、全トランスクリプト移植法を用いた網羅的なバリアント探索  さらに(1)、(2)、(3)に関しては、in vitroハイスループットスクリーニングも施行し、in vivo、in silicoの結果と統合し、バリアントの最終判定を行う。中央西日本遺伝性腫瘍コホート研究におけるVUSに関しては、機能的な予測情報も含めて米国・ゲノム変異情報データベース (ClinVar)へ情報提供し、実臨床例に対しては病原性推定結果のsegregationデータを取り、実臨床への返還にも努める。
研究概要(2022)
以下(1)~(4)について遺伝性腫瘍に見られるVUSのin vivo機能的アノテーションを行い、中杤らによるin silico機能的アノテーションの結果と統合する。(1)BRCA1/2に見られるVUSに対する、多次元機能的アノテーション((1)バリアントをまとめて、(2)バリアントを個々に)(2)DDR遺伝子群に見られるVUSの組み合わせに対する、多次元機能的アノテーション((2)バリアントを個々に)(3)TP53に見られるVUSに対する、多次元機能的アノテーション((1)バリアントをまとめて)(4)家族性の集積を認めるが、遺伝子変異が見いだせなかった症例に対する、全トランスクリプト移植法を用いた網羅的なバリアント探索さらに(1)、(2)、(3)に関しては、in vitroハイスループットスクリーニングも施行し、in vivo、in silicoの結果と統合し、バリアントの最終判定を行う。中央西日本遺伝性腫瘍コホート研究におけるVUSに関しては、機能的な予測情報も含めて米国・ゲノム変異情報データベース (ClinVar)へ情報提供し、実臨床例に対しては病原性推定結果のsegregationデータを取り、実臨床への返還にも努める。
研究成果情報
2024
2023
2022