B型肝炎ウイルス（HBV）のポリメラーゼのタンパク質合成が難しいことから、HBVポリメラーゼを標的にした阻害剤探索は進んでいない。そこで本研究チームは、情報科学の力を集積したAIデザインによりHBVポリメラーゼの合成を試み、阻害剤探索を目指してきた。今年度は、近位依存性ビオチン標識AirID細胞内でHBVpolと会合する宿主因子をプローブに、AIデザインで合成量・可溶化率が向上したAIデザインHBVのポリメラーゼを対象とした薬剤探索を進めた。さらに、機械学習型AIを用いたHBVpolの改変研究の成果として、HBVpolタンパク質–HBVプレゲノムRNAの相互作用を指標とした薬剤探索アッセイ系の構築に成功し、東京大学創薬機構から取得した薬剤ライブラリーによる結合阻害薬剤スクリーニングを行い、複数種類の候補薬剤を見出している。現在、これらの化合物の詳細な解析を進めている。
細胞内でHBVpolと会合しウイルス複製に寄与しうる宿主因子の探索を行った。近位ビオチン化酵素AirIDとの融合タンパク質を構築してLC-MS/MSにより相互作用因子を網羅的に解析し、同定したHBVpol高親和性因子群についてHBV産生への関与を評価した。鉄-硫黄クラスターを有する宿主因子が、HBVpolと直接結合すること、感染細胞の遺伝子ノックダウンによってHBV pregenomic RNAレベルは変化しないものの感染性ウイルス産生が顕著に低下することを見出した。このタンパク質を、HBVpol binding protein（HBVpolBP1）と命名した。
見出したHBVpolBP1はHBV pol活性を正に制御する宿主因子として働く可能性が示唆されたため、HBV pol–HBVpolBP1相互作用を抑制する薬剤取得を目指した。AlphaScreen技術を基盤として、HBV pol–HBVpolBP1相互作用阻害薬探索のアッセイ系の構築を行った。３万種以上の化合物を使用したHBV pol–HBVpolBP1相互作用阻害薬のスクリーニングを進めた。その結果、基本骨格が似ている4種類の化合物がHBV pol–HBVpolBP1間の相互作用を阻害する活性を有していること示された。現在、これらの化合物の詳細な解析を進めている。