R5年度は、病原真菌アスペルギルスフミガタスの集団ゲノミクス解析、宿主進化解析、核酸送達技術開発を進めた。集団ゲノミクス解析では、日本分離株170株と海外分離株の合計876株に及ぶ世界最大規模での系統解析を実施し、その集団構造解析によって、日本で分離される菌株の遺伝背景に特徴があることを明らかとした。さらに、アゾール薬耐性の原因となりうる候補領域の特定を進め、ハイリスク系統の特徴の一端を解明し、国際誌にて発表した。カイコモデルによるアゾール薬の効果測定に関する技術開発も進め、国際誌にて発表した。
次に、宿主進化解析では、同一患者由来の菌株のゲノム解析を進め、単一の感染株から時間経過とともに多様化する様子をゲノムレベルの解像度で初めて明らかにした。若手研究者を英国Imperial College Londonの研究室に派遣し、大規模表現型解析に関する技術習得を進めた。その結果、384種類の表現型データの取得に成功し、宿主感染中に4つの条件に対する応答が変化していたことから、長期間の感染中においてもその形質が維持されることが見えてきた。現在、この測定技術の国内への移植作業を進めており、国際連携による大きな成果であった。
最後に、核酸送達技術開発を進め、膜小胞の高産生条件を見出し、核酸の封入条件の検討を進めた。