新型コロナウイルス感染症（COVIV-19）のパンデミックから４年以上が経過した。近年では罹患者が退院後も、倦怠感や嗅覚・味覚障害など多彩な後遺症を認めることが報告されている。代表者はCOVID-19の診療に携わる100以上の医療機関からなる全国ネットワーク(コロナ制圧タスクフォース)のメンバーとして参画し、症例登録は、6,400例を超え、初期に集積した約2,400例のゲノムワイド関連解析により日本人集団初のCOVID-19疾患感受性遺伝子DOCK2を同定し2022年に論文発表した（Namkoong H et al. Nature, 2022）。一方1,000例の後遺症研究は代表者の前勤務施設（慶應大学）が主導しており、代表者は異動後も参画している。慶應大学の症例には、ゲノム解析研究と後遺症調査研究の双方に同意を得た症例が200例以上存在し、本研究では、両研究を紐づけ後遺症感受性遺伝子の同定を試みた。COVID-19に罹患後3カ月以上何らかの症状が持続している症例を後遺症有りとし、何も症状を認めないものを後遺症無しとして、計219例を抽出し、国際研究コンソーシアムCOVID-19 Host Genetics Initiativeにデータを提出し、統合解析を行った。その結果、COVID-19の重症化にもかかわると報告されているFOXP4がリスク遺伝子であることを同定し、プレプリントで発表し(Lammi, Ishii et al. medRxiv, 2023)、現在論文リバイス投稿中である。またヒト初代気道上皮細胞にFOXP4過剰発現あるいはノックダウンを行いFOXP4の機能解析を進めている。そして、COVID-19罹患者および健常者の鼻腔上皮オルガノイド培養を行い、RNAseqでは、COVID-19罹患者(20例)と健常者(10例)では異なるクラスターを形成し、COVID-19罹患者では分泌細胞・線毛に関わる遺伝子発現が亢進した。嗅覚障害罹患後症状を有する症例はオミクロン流行下で、COVID-19罹患者20例中2例のみで統計解析はできなかった。さらに後遺症研究参加者の約200例のプロテオミクス解析も提出し検討中である。