tNGSによる迅速な結核菌耐性予測について、多検体で精度を確認した。また、臨床検体から直接ゲノム解析を行うための基礎技術を確立した。迅速な結核感染診断法としてQIAReachの評価を行い、QFT-Plusと同等であることを示した。（御手洗）
　結核患者全血液mRNA転写開始点網羅探索で得られた、結核時に発現誘導される候補5'エクソンのRT-qPCRによる発現定量系を構築し、多数の結核患者全血液検体で測定した。候補5'エクソンの発現量は、結核宿主マーカーとして有用である可能性が示された。（慶長）
　転写因子欠損株のマウス内での増殖からRv2989によって制御される遺伝子の同定を行った。変異株ライブラリーを用いたマウス内での生存に関与する遺伝子から、転写因子標的遺伝子の同定を行い、6遺伝子についてCRISPR遺伝子発現干渉法を用いて発現制御できる結核菌株を構築した。（瀬戸）
　M. heraklinonensis, M. hiberniae, M. kumamotonensis, M. longobardus, M. paraterraeの5種、計389細胞をcryo-TEMで観察し、画像解析した。平均菌体直径は科内の他の属より有意に小さかった。（山田）
　首都圏の自治体で収集された結核菌1,584株のゲノム情報をデータベース化し、ゲノムサーベイランスシステムの基盤を構築した。また、結核菌ゲノム解読のための標準作業手順書を作成し公開した(2023年7月)。（村瀬）
　神戸市内分離株550株のゲノム情報を収集し、ゲノムクラスター形成群、高齢者由来菌株群に着目した、全ゲノム系統樹末端枝長分布解析を行い、北京型L2.2.AA2系統とL2.2.Modern系統が感染拡大のリスクであることを解明した。遺伝系統を規定する塩基配列を疫学マーカーとすることで、感染拡大リスクの評価が可能となることを示しえた。（岩本）
　結核菌株ゲノムデータから、同一患者内に混在する複数の菌株を詳細分析し、国内流行地域の中で未把握の集団感染事例を多数確認した。若年患者の疫学調査から、患者居住地間の距離と菌株ゲノムに相関が見出され、結核菌の空間的拡散が確認された一方、行政区を超えた情報集約が重要であることも示された。（和田）
　疫学情報とゲノム情報の統合ツール PomeGraph を完成させた。ゲノム情報解析の技術研修会を複数回実施することできた。Pomegraph による実地疫学とゲノム情報の融合にチャレンジし、効果的な情報提示ができたと評価頂いた。（黒田）
　種々の増殖条件及び異なる系統の結核において増殖に必須な遺伝子群を同定した。解析を進め、結核菌のpan-essential遺伝子群を同定した。これらの遺伝子について結核菌遺伝子ノックダウン株を解析した。（港）