抗菌薬の効かない薬剤耐性(AMR)菌が引き起こす感染症は、その患者自体の治療を困難にするだけでなく深刻な経済的損失をもたらすため、社会的インパクトが非常に大きい。このAMR問題を解決するには、既存の感染制御対策に加え、AMR対策を重視した抜本的な施策を講じる必要がある。それは、耐性遺伝子プロファイルに立脚した薬剤感受性情報に基づく適正な抗菌治療を実施することと、効果的な感染制御対策を実施するための高精度な細菌ゲノム疫学調査を徹底することである。しかし、現行の感染制御対策の細菌遺伝子検査やジェノタイピングなどの技術は、コスト・精度・簡便性などの点において、現場の要求を満たしていない。MRSA感染症の発生と流行状況を迅速に把握するための低コストで簡便に、かつ一度の操作で全ての遺伝子検査と細菌ゲノム疫学調査が可能な革新的な検査法を開発しAMR対策に寄与する。