研究課題情報
課題管理番号
22wm0325015h0003
統合プロジェクト(二期)

疾患基礎研究プロジェクト<第二期>

事業名

新興・再興感染症研究基盤創生事業

タグ(2022)

研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究

開発フェーズ: 該当なし

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: その他

疾患領域: がん

開発目的: 予防・健康 ,  診断

タグ(2021)

研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究

開発フェーズ: 基礎的

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: その他

疾患領域: がん

開発目的: 予防・健康 ,  診断

タグ(2020)

研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究

開発フェーズ: 基礎的

承認上の分類: 医薬品

対象疾患: その他

疾患領域: がん ,  難病 ,  感染症

開発目的: 予防・健康 ,  診断

代表研究機関
国立大学法人熊本大学
研究代表者

(2022) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター 教授

(2021) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター 教授

(2020) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター 教授

研究期間
2020年度 - 2022年度
課題への総配分額
66,800 千円
研究概要(2022)
HTLV-1慢性持続潜伏感染成立・維持・病原性発現に重要な因子検索するために、HTLV-1感染者の検体を用いて、シングルセル解析を担当する。研究手法としては、主に10x Chromiumシステムを用いたscRNA-seqおよびscATAC-seq解析を行う。対象とする感染者は、無症候性感染者、ATL患者、HAM患者、HTLV-1感染リウマチ患者である。基本的に末梢血液中の単核球を解析するが、HAM患者、HTLV-1感染リウマチ患者においては、それぞれの炎症部位である脳脊髄液および関節液も同時解析する。HAM患者脳脊髄液検体の比較対照検体として、多発性硬化症患者の脳脊髄液検体を解析する予定である。これまでに研究開発代表者が開発してきたHTLV-1特異的DNAプローブや感染細胞の検出感度を高めるCITE-seq用CADM1抗体を活用して、高精度なシングルセルデータを取得し、1次データ解析を行い、情報数理科学解析チームに提供すると共に、臨床医学チームへの結果のフィードバックを行う。シングルセル解析・ウイルス学の専門家として、多分野連携ディスカッションに加わり、本研究班の研究成果の臨床応用に貢献する。また、研究開発代表者として班会議を開催したり、個別のミーティングを設定したりして、多分野融合研究促進を先導する。
研究概要(2021)
HTLV-1慢性持続潜伏感染成立・維持・病原性発現に重要な因子検索するために、HTLV-1感染者の検体を用いて、シングルセル解析を担当する。研究手法としては、主に10x Chromiumシステムを用いたscRNA-seqおよびscATAC-seq解析を行う。対象とする感染者は、無症候性感染者、ATL患者、HAM患者、HTLV-1感染リウマチ患者である。基本的に末梢血液中の単核球を解析するが、HAM患者、HTLV-1感染リウマチ患者においては、それぞれの炎症部位である脳脊髄液および関節液も同時解析する。HAM患者脳脊髄液検体の比較対照検体として、多発性硬化症患者の脳脊髄液検体を解析する予定である。これまでに研究開発代表者が開発してきたHTLV-1特異的DNAプローブや感染細胞の検出感度を高めるCITE-seq用CADM1抗体を活用して、高精度なシングルセルデータを取得し、1次データ解析を行い、情報数理科学解析チームに提供すると共に、臨床医学チームへの結果のフィードバックを行う。シングルセル解析・ウイルス学の専門家として、多分野連携ディスカッションに加わり、本研究班の研究成果の臨床応用に貢献する。また、研究開発代表者として班会議を開催したり、個別のミーティングを設定したりして、多分野融合研究促進を先導する。
研究概要(2020)
HTLV-1慢性持続潜伏感染成立・維持・病原性発現に重要な因子検索するために、HTLV-1感染者の検体を用いて、シングルセル解析を担当する。研究手法としては、主に10x Chromiumシステムを用いたscRNA-seqおよびscATAC-seq解析を行う。対象とする感染者は、無症候性感染者、ATL患者、HAM患者、HTLV-1感染リウマチ患者である。基本的に末梢血液中の単核球を解析するが、HAM患者、HTLV-1感染リウマチ患者においては、それぞれの炎症部位である脳脊髄液および関節液も同時解析する。HAM患者脳脊髄液検体の比較対照検体として、多発性硬化症患者の脳脊髄液検体を解析する予定である。これまでに研究開発代表者が開発してきたHTLV-1特異的DNAプローブや感染細胞の検出感度を高めるCITE-seq用CADM1抗体を活用して、高精度なシングルセルデータを取得し、1次データ解析を行い、情報数理科学解析チームに提供すると共に、臨床医学チームへの結果のフィードバックを行う。シングルセル解析・ウイルス学の専門家として、多分野連携ディスカッションに加わり、本研究班の研究成果の臨床応用に貢献する。また、研究開発代表者として班会議を開催したり、個別のミーティングを設定したりして、多分野融合研究促進を先導する。
研究成果情報
2022
2021
2020