研究課題情報
- 課題管理番号
- 22tm0724605h0001
- 統合プロジェクト(二期)
ゲノム・データ基盤プロジェクト<第二期>
- 事業名
ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム<B-cure>
- タグ(2022)
研究の性格: 研究基盤及び創薬基盤の整備研究<創薬技術・ICT基盤・プラットフォーム関係含む>
開発フェーズ: 該当なし
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: その他
疾患領域: 生活習慣病
開発目的: 予防・健康 , 診断 , 治療 , 生活の質<QOL>
- 代表研究機関
- 国立大学法人岡山大学
- 研究代表者
(2022) 遠西大輔, 国立大学法人岡山大学, 岡山大学病院 ゲノム医療総合推進センター 研究教授
- 研究期間
- 2022年度 - 2022年度
- 課題への総配分額
- 83,330 千円
- 研究概要(2022)
- 岡山大学病院バイオバンク(岡大BB)に保存されているCOPD患者・50症例を対象に、血液(PBMC)サンプルから核酸(DNA)を抽出し、全ゲノム解析(WGS)を実施する。またWGSを実施した同一COPD患者の肺組織から抽出した核酸(DNA)をもとに、全エクソン解析(WES)を実施する。同様に、肺組織から抽出した核酸(RNA)をもとに、網羅的な全トランスクリプトーム解析(WTS)を実施する。さらに同一肺組織を用いて、空間的(spatial)な位置情報を保持したトランスクリプトーム・プロテオーム解析(GeoMx)を実施し、COPD組織内の局所におけるマルチオミックス・プロファイルを明らかにする。上記症例の肺組織サンプルに加え、口腔内、糞便から抽出したDNAを用いてメタゲノム解析を実施し、COPD症例に特異的な横断的マイクロバイオームに関するデータを取得する。さらに、10症例については、一細胞・遺伝子発現解析(single-cell RNAseq)、表面抗原解析(CITEseq)、遺伝子変異解析(single-cell DNAseq)を統合した、シングルセル・マルチオミックス解析を実施することで、COPDにおける深層なレベルでのマルチオミックスデータセットを世界に先駆けて構築する。
研究成果情報
2022
成果の概要
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