研究課題情報
課題管理番号
22tm0724605h0001
統合プロジェクト(二期)

ゲノム・データ基盤プロジェクト<第二期>

事業名

ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム<B-cure>

タグ(2022)

研究の性格: 研究基盤及び創薬基盤の整備研究<創薬技術・ICT基盤・プラットフォーム関係含む>

開発フェーズ: 該当なし

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: その他

疾患領域: 生活習慣病

開発目的: 予防・健康 ,  診断 ,  治療 ,  生活の質<QOL>

代表研究機関
国立大学法人岡山大学
研究代表者

(2022) 遠西大輔, 国立大学法人岡山大学, 岡山大学病院 ゲノム医療総合推進センター 研究教授

研究期間
2022年度 - 2022年度
課題への総配分額
83,330 千円
研究概要(2022)
岡山大学病院バイオバンク(岡大BB)に保存されているCOPD患者・50症例を対象に、血液(PBMC)サンプルから核酸(DNA)を抽出し、全ゲノム解析(WGS)を実施する。またWGSを実施した同一COPD患者の肺組織から抽出した核酸(DNA)をもとに、全エクソン解析(WES)を実施する。同様に、肺組織から抽出した核酸(RNA)をもとに、網羅的な全トランスクリプトーム解析(WTS)を実施する。さらに同一肺組織を用いて、空間的(spatial)な位置情報を保持したトランスクリプトーム・プロテオーム解析(GeoMx)を実施し、COPD組織内の局所におけるマルチオミックス・プロファイルを明らかにする。上記症例の肺組織サンプルに加え、口腔内、糞便から抽出したDNAを用いてメタゲノム解析を実施し、COPD症例に特異的な横断的マイクロバイオームに関するデータを取得する。さらに、10症例については、一細胞・遺伝子発現解析(single-cell RNAseq)、表面抗原解析(CITEseq)、遺伝子変異解析(single-cell DNAseq)を統合した、シングルセル・マルチオミックス解析を実施することで、COPDにおける深層なレベルでのマルチオミックスデータセットを世界に先駆けて構築する。
研究成果情報
2022