研究課題情報
課題管理番号
22jm0210074h0004
統合プロジェクト(二期)

シーズ開発・研究基盤プロジェクト<第二期>

9つの連携分野プロジェクト

その他<第一期>

事業名

医療分野国際科学技術共同研究開発推進事業

タグ(2022)

研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究

開発フェーズ: 該当なし

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: その他

疾患領域: 感染症

開発目的: 予防・健康 ,  診断

タグ(2021)

研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究

開発フェーズ: 基礎的

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: その他

疾患領域: 感染症 ,  がん

開発目的: 予防・健康 ,  診断

タグ(2020)

研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究

対象疾患: その他

疾患領域: がん ,  感染症

タグ(2019)

研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究

開発フェーズ: 該当なし

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: 該当なし<対象とする疾患なし>

代表研究機関
国立大学法人熊本大学
研究代表者

(2022) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター 教授

(2021) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター 教授

(2020) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター 教授

(2019) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター 教授

研究期間
2019年度 - 2023年度
課題への総配分額
41,299 千円
研究概要(2022)
本研究課題ではHTLV-1感染細胞および感染者末梢血検体を最新のシングルセル技術を使って解析し、感染細胞におけるウイルス遺伝子発現のより詳細な解析、更にはその制御メカニズムを明らかにするために研究を進める。日本側では既に進行中のJ-PRIDEの研究プロジェクトとリンクさせ、取得済みのシングルセルRNA-seqデータも活用する。英国側では1細胞からゲノムDNAとRNA発現を同時取得し解析をするという解析系が立ち上げられており、2つのシングルセル解析を結合する事によって、HTLV-1感染病態のより詳細な解明へ向けた日英間共同研究を進めることが目標である。今年度は HTLV-1感染者検体を用いて、10x Genomics社のシステムでシングルセルRNA-seqデータを取得する。ウイルス遺伝子検出感度を最大化するために、DNA-capture-seqを併用する。RNAとタンパクを同時に評価するためにCITE-seqを行う。本年度の解析症例数は5例を予定している。加えて、令和4年度春の調整費措置を受け、現在流行している新型コロナウイルス感染症を例として、一度に多くの変異を調べることが可能な、ウイルス変異多項目迅速検出検査法の研究開発を行う。英国側共同研究先での研究開発期間の延長(新型コロナの影響による)にあわせ、日本側でも令和5年12月末まで期間を延長する。日本側で令和4年度に予定していた実験は令和4年度内に終了するが、延長期間中に英国側研究者の来日を受け入れ、研究成果を取りまとめる。
研究概要(2021)
本研究課題ではHTLV-1感染細胞および感染者末梢血検体を最新のシングルセル技術を使って解析し、感染細胞におけるウイルス遺伝子発現のより詳細な解析、更にはその制御メカニズムを明らかにするために研究を進める。日本側では既に進行中のJ-PRIDEの研究プロジェクトとリンクさせ、取得済みのシングルセルRNA-seqデータも活用する。英国側では1細胞からゲノムDNAとRNA発現を同時取得し解析をするという解析系が立ち上げられており、2つのシングルセル解析を結合する事によって、HTLV-1感染病態のより詳細な解明へ向けた日英間共同研究を進めることが目標である。今年度は HTLV-1感染者検体を用いて、10x Genomics社のシステムでシングルセルRNA-seqデータを取得する。ウイルス遺伝子検出感度を最大化するために、DNA-capture-seqを併用する。RNAとタンパクを同時に評価するためにCITE-seqを行う。本年度の解析症例数は5例を予定している。
研究概要(2020)
本研究課題ではHTLV-1感染細胞および感染者末梢血検体を最新のシングルセル技術を使って解析し、感染細胞におけるウイルス遺伝子発現のより詳細な解析、更にはその制御メカニズムを明らかにするために研究を進める。日本側では既に進行中のJ-PRIDEの研究プロジェクトとリンクさせ、取得済みのシングルセルRNA-seqデータも活用する。英国側では1細胞からゲノムDNAとRNA発現を同時取得し解析をするという解析系が立ち上げられており、2つのシングルセル解析を結合する事によって、HTLV-1感染病態のより詳細な解明へ向けた日英間共同研究を進めることが目標である。今年度は HTLV-1感染者検体を用いて、10x Genomics社のシステムでシングルセルRNA-seqデータを取得する。ウイルス遺伝子検出感度を最大化するために、DNA-capture-seqを併用する。RNAとタンパクを同時に評価するためにCITE-seqを行う。本年度の解析症例数は5例を予定している。
研究概要(2019)
本研究課題ではHTLV-1感染細胞および感染者末梢血検体を最新のシングルセル技術を使って解析し、感染細胞におけるウイルス遺伝子発現のより詳細な解析、更にはその制御メカニズムを明らかにするために研究を進める。日本側では既に進行中のJ-PRIDEの研究プロジェクトとリンクさせ、取得済みのシングルセルRNA-seqデータも活用する。英国側では1細胞からゲノムDNAとRNA発現を同時取得し解析をするという解析系が立ち上げられており、2つのシングルセル解析を結合する事によって、HTLV-1感染病態のより詳細な解明へ向けた日英間共同研究を進めることが目標である。今年度は HTLV-1感染者検体を用いて、10x Genomics社のシステムでシングルセルRNA-seqデータを取得する。ウイルス遺伝子検出感度を最大化するために、DNA-capture-seqを併用する。RNAとタンパクを同時に評価するためにCITE-seqを行う。初年度の解析症例数は5例を予定している。
研究成果情報
2022
2021
2020
2019