DAA治療をうけ不成功であった症例を継続的に全国規模で集積した。2022年登録例のうちGLE/PIB不成功例は59％、SOF/VEL不成功例が16％であった。DAA治療不成功例のNS5A領域93変異、31変異は、従来DAA不成功では75％、66％に対し、GLE/PIB不成功ではそれぞれ22％、49％であった。DAA治療不成功例に対する再治療のウイルス排除成功（SVR）率は、GLE/PIBGLE/PIBは98％、SOF/VEL+RBVは97％であった。ゲノタイプ1bではGLE/PIB再治療のSVR率は、P32delでは10％、A92Kでは86％、A92K+Q24K+L28Mでは60％であった。SOF/VEL+RBV再治療のSVR率はP32delでは92％、A92KあるいはA92K+Q24K+L28Mでは100％であったが、F37Lでは94％であった。ゲノタイプ2型では薬剤耐性変異と治療不成功の因果関係は特定することができなかった。これらの解析結果を踏まえ、薬剤耐性に基づいて再治療効果を予測し適切な治療薬選択をするための再治療指針を作成し、日本肝臓学会C型肝炎治療ガイドラインの再治療の薬剤選択フローチャートに取り入れられた。
厚労省肝炎等克服政策研究事業研究班と連携して実施した肝炎医療指標調査では、DAA再治療前の耐性変異検査の実施指標は、経年的に0.47から0.90に改善した。
薬剤耐性のin vitro解析では、P32del、A92KはVELに対して高度耐性であり、A92K複合変異ではウイルス産生が増強された。L37FはNS5A阻害剤高濃度においてもわずかに残存した。
Deep sequenceにより検出される少数の変異ウイルスも治療不成功に関与した。nanoporeを用いたsequenceにより、ゲノタイプ2における治療不成功後のウイルス変化が確認できた。
複数の多施設共同研究コホートにより、肝線維化非進展例において、年齢、ALT値およびAFP値の組み合わせにより肝発がんリスクの層別化が可能となること、７0歳未満の女性で血小板13万以上の症例は長期経過においても発がんしにくい集団であること、肝がんがミラノ基準内の早期ステージであれば肝がん治療後のウイルス排除により肝がん再発率、生存率ともに改善するが、ミラノ基準外の中間ステージでは生存率のみ改善する傾向があることを示した。