難プラ標準レジストリーを使用し、新生児マススクリーニング対象疾患等の遺伝子変異を考慮したガイドライン改定に向けたエビデンス創出研究
研究課題情報
- 課題管理番号
- 22ek0109482h0003
- 統合プロジェクト(二期)
ゲノム・データ基盤プロジェクト<第二期>
- 事業名
難治性疾患実用化研究事業
- タグ(2022)
研究の性格: 研究基盤及び創薬基盤の整備研究<創薬技術・ICT基盤・プラットフォーム関係含む>
開発フェーズ: 該当なし
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: その他
疾患領域: 難病 , 成育
開発目的: 予防・健康 , 診断 , 治療 , 生活の質<QOL>
- タグ(2021)
研究の性格: 研究基盤及び創薬基盤の整備研究<創薬技術・ICT基盤・プラットフォーム関係含む>
開発フェーズ: 該当なし
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: その他
開発目的: 診断
- タグ(2020)
研究の性格: 医療技術・標準治療法の確立等につながる研究<診療の質を高めるためのエビデンス構築<診療ガイドライン作成等>を含む>
開発フェーズ: 観察研究等
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: その他
疾患領域: 難病
開発目的: 治療
- 代表研究機関
- 国立大学法人東海国立大学機構
- 研究代表者
(2022) 笹井英雄, 国立大学法人東海国立大学機構, 岐阜大学 大学院医学系研究科小児科学・助教
(2021) 笹井英雄, 国立大学法人東海国立大学機構, 岐阜大学大学院医学系研究科小児科学・助教
(2020) 笹井英雄, 国立大学法人東海国立大学機構, 岐阜大学 医学部附属病院 ・助教
- 研究期間
- 2020年度 - 2022年度
- 課題への総配分額
- 38,105 千円
- 研究概要(2022)
- 新生児マススクリーニング対象疾患等について、遺伝子パネルを用いた診断とフォローアップの事業を前年度に引き続き継続していく。また、難病プラットフォーム標準レジストリーシステムの運用を継続する。本研究班の開発分担者以外に、レジストリーシステムの運用にあたっては全国に32名の代謝疾患を診療する先生に「先天代謝異常症の難病プラットフォームレジストリーを用いたフォローアップ研究RADDAR-J [30]」という研究への分担研究者となってもらっており、本研究班では研究協力者として患者登録に協力していただき登録症例を増やしていく。これまで先行研究で構築したレジストリーに関しても本レジストリーへの移行を引き続き進めていく。新たな症例の登録も積極的に行い、フォローアップ体制を整える。
- 研究概要(2021)
- 新生児マススクリーニング対象疾患等について、遺伝子パネルを用いた診断とフォローアップの事業を前年度に引き続き継続していく。また、難病プラットフォーム標準レジストリーシステムの運用の本格運用を開始する。本研究班の開発分担者以外に、レジストリーシステムの運用にあたっては全国に32名の代謝疾患を診療する先生に「先天代謝異常症の難病プラットフォームレジストリーを用いたフォローアップ研究RADDAR-J [30]」という研究への分担研究者となってもらっており、本研究班では研究協力者として患者登録に協力していただき登録症例を増やしていく。これまで先行研究で構築したレジストリーに関しても本レジストリーへの移行を引き続き進めていく。新たな症例の登録も積極的に行い、フォローアップ体制を整える。
- 研究概要(2020)
- 新生児マススクリーニング対象疾患等について、遺伝子パネルを用いた診断とフォローアップの事業を前年度に引き続き継続していく。効率のいい改訂遺伝子パネルの設計、運用を本年度中におこなう。また、難病プラットフォーム標準レジストリーシステムの運用の維持、管理を開始する。本研究班の開発分担者以外に、レジストリーシステムの運用にあたっては全国に32名の代謝疾患を診療する先生に「先天代謝異常症の難病プラットフォームレジストリーを用いたフォローアップ研究RADDAR-J [30]」という研究への分担研究者となってもらっており、本研究班では研究協力者として患者登録に協力していただく体制を取る。これまで先行研究で構築したレジストリーに関しても本レジストリーへの移行を進めていく。新たな症例の登録も積極的に行い、フォローアップ体制を整える。
研究成果情報
2022
2021
2020
成果の概要
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当研究班では新生児マススクリーニング(NBS)対象疾患等の先天代謝異常症を対象として、大きく2つのプロジェクトで研究を進めてきた。一つの研究の柱は遺伝子変異を同定してフォローアップする研究である。AMED深尾班の先行研究で遺伝子パネルを用いて疾患の遺伝子解析を行い、研究班で運用する仕組みが構築されていたが、当研究班では引き続きフォローアップ研究を継続した。そして、さらにそれを維持・発展させるべく難病プラットフォーム標準レジストリー(難プラ)を用いた対象疾患のレジストリーを確立し、遺伝子変異を確定してフォローする体制作りを目指している。この研究には全国40名近い先天代謝異常症の専門家が参加しており、令和4年度は引き続きその体制整備・運用を進めた。遺伝子パネルに関しては、先行研究からの9年間(平成26年1月から令和5年3月)で、762症例の解析を行った(令和4年度としては110症例の解析を行った)。その中で、NBSによって発見された症例は463症例であるが、およそ71%の症例で責任遺伝子に変異を同定できている。フォローアップ研究を継続しながら、これらの症例の臨床像を蓄積している。そして、一部の症例は難プラを用いた詳細な登録へと移行を開始しており、現在19症例が登録されているが、今後、登録症例数をさらに増やしていく予定である。もう一つの研究の柱はガイドライン改訂に向けたクリニカルクエスチョン(CQ)へのエビデンス創出である。遺伝子型による個別化ガイドラインのエビデンス提供を複数の疾患において行うことを目的としており、遺伝子変異の同定後のフォローアップとリンクしたものを中心に、10のCQを立てて研究を進めた。そのなかで、種々の成果が出てきており、一例として、尿素サイクル異常症における長期予後や、OTC欠損症における特定の遺伝型とQOL低下との関連等が明らかになり、これらは先天代謝異常分野の最高の雑誌であるJIMD等で報告された。また、先行研究から問題になっていたVLCAD欠損症でのNBS前後における日本人患者でのC607S変異の出現率の変容とその活性値の関連についても報告された。対象疾患についてのレジストリーに症例が蓄積され、今後のNBS対象疾患等の診療に役立つ情報が蓄積されることで、将来的にはいくつかの疾患で遺伝子型に基づく個別の診療ガイドラインの改訂が期待できる。
学会誌・雑誌等における論文一覧
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1. Kanno T, Miyako K, Nakajima T, Yokoyama S, Sasamoto S, Asou HK, Ohara O, Nakayama T, Endo Y. SCD2-mediated cooperative activation of IRF3-IRF9 regulatory circuit controls type I interferon transcriptome in CD4+ T cells. Front Immunol. 2022 13:904875. doi: 10.3389/fimmu.2022.904875.
2. Ishikawa M, Konno R, Nakajima D, Gotoh M, Fukasawa K, Sato H, Nakamura R, Ohara O, Kawashima Y. Optimization of Ultrafast Proteomics Using an LC-Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer with Data-Independent Acquisition. J Proteome Res. 2022 21(9):2085-2093. doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00121.
3. Kawashima Y, Nagai H, Konno R, Ishikawa M, Nakajima D, Sato H, Nakamura R, Furuyashiki T, Ohara O. Single-Shot 10K Proteome Approach: Over 10,000 Protein Identifications by Data-Independent Acquisition-Based Single-Shot Proteomics with Ion Mobility Spectrometry. J Proteome Res. 2022 Jun 3;21(6):1418-1427. doi:10.1021/acs.jproteome.2c00023.
4. Sato H, Nakajima D, Ishikawa M, Konno R, Nakamura R, Ohara O, Kawashima Y. Evaluation of the Suitability of Dried Saliva Spots for In-Depth Proteome Analyses for Clinical Applications. J Proteome Res. 2022 21(5):1340-1348.doi: 10.1021/acs.jproteome.2c00099.
5. Liu Z, Zhang L, Ren C, Xu M, Li S, Ban R, Wu Y, Chen L, Sun S, Elstner M, Shimura M, Ogawa-Tominaga M, Murayama K, Shi T, Prokisch H, Fang F. Neonatal-onset mitochondrial disease: clinical features, molecular diagnosis and prognosis.. J Med Genet. 2022 Apr;59(4):351-357. doi: 10.1136/jmedgenet-2020-107383.
6. Ebihara T, Nagatomo T, Sugiyama Y, Tsuruoka T, Osone Y, Shimura M, Tajika M, Matsuhashi T, Ichimoto K, Matsunaga A, Akiyama N, Ogawa-Tominaga M, Yatsuka Y, Nitta KR, Kishita Y, Fushimi T, Imai-Okazaki A, Ohtake A, Okazaki Y, Murayama K. Neonatal-onset mitochondrial disease: clinical features, molecular diagnosis and prognosis. Arch Dis Child Fetal Neonatal Ed. . 2022 May;107(3):329-334. doi: 10.1136/archdischild-2021-321633.
7. Imai-Okazaki A, Nitta KR, Yatsuka Y, Sugiura A, Arao M, Shimura M, Ebihara T, Onuki T, Ichimoto K, Ohtake A, Murayama K, Okazaki Y. Impact of measuring heteroplasmy of a pathogenic mitochondrial DNA variant at the single-cell level in individuals with mitochondrial disease. J Inherit Metab Dis. Nov 2022, 45(6), 1143-50, doi:10.1002/jimd.12547.
8. Burgin H, Sharpe AJ, Nie S, Ziemann M, Crameri JJ, Stojanovski D, Pitt J. Ohtake A, Murayama K, McKenzie M. Loss of mitochondrial fatty acid β-oxidation protein short-chain Enoyl-CoA hydratase disrupts oxidative phosphorylation protein complex stability and function. FEBS J. 2022 Aug 13. doi: 10.1111/febs.16595. Online ahead of print.
9. Kido J, Sugawara K, Sawada T, Matsumoto S, Nakamura K. Pathogenic variants of ornithine transcarbamylase deficiency: Nation-wide study in Japan and literature review. Frontiers in Genetics, 2022, 13, 952467, doi: 10.3389/fgene.2022.952467
10. Saito Y, Nakamura K, Fukuda T, Sugie H, Hayashi S, Noguchi S, Nishino I. Muscle biochemical and pathological diagnosis in Pompe disease. J Neurol Neurosurg Psychiatry. Apr 25 2022, doi:10.1136/jnnp-2022-329085.
学会・シンポジウム等における口頭・ポスター
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1. Hamazaki T.et.al. Study 165-305: Interim safety and efficacy of pegvaliase in Japanese adults with phenylketonuria. the 45th Human Genetics Society of Australasia (HGSA) Annual Scientific Meeting; 2022年11月; 豪州, 海外, ポスター.
国外 / ポスター
2. 新生児マススクリーニングの脂肪酸代謝異常症精査例における血清アシルカルニチン分析結果の検討. 松井美樹、小林弘典、野津吉友、山田健治、長谷川有紀、山口清次、竹谷健. 日本マス・スクリーニング学会学術集会(第49回 大阪市)2022/8/26-27,国内,口演
国内 / 口頭
3. 登録衛生検査所における希少難病の遺伝学的検査の現状、小原 收、IRUD Workshop 2022/7/22. 国内、口頭(招待)
国内 / 口頭
4. 遺伝学的検査、どれを選ぶ?、小原 收、第18回日本先天代謝異常学会セミナー、2022/7/16, 国内、口頭(招待)
国内 / 口頭
5. オミックス時代の新生児スクリーニング:計測技術的な観点から、小原 收、第45回日本小児遺伝学会学術集会、2023/1/28, 国内、口頭(招待)
国内 / 口頭
6. ミトコンドリア障害における肝疾患? 村山 圭,第15 回 APPSPGHAN 会議,2022/10/12-15,国外,招待講演
国外 /
7. ミトコンドリア病における病態モニタリング 特殊性化学検査、バイオマーカー、変異率など,村山 圭,第18回日本先天代謝異常学会セミナー,2022/7/16-17, 国内,講義.
国内 /
8. ミトコンドリア病Up To Date,村山 圭,北大小児科特別集談会,2022/8/2,国内,講演.
国内 /
9. ミトコンドリア心筋症 Up to Date,村山 圭,第26回日本心不全学会学術集会,2022/10/21-23,国内,シンポジウム
国内 /
10. グローバルメディカルサイエンス特別講演,村山 圭,国立大学法人 神戸大学大学院医学研究科 グローバルメディカルサイエンス特別講演,2022/12/2,国内,特別講演
国内 /
「国民との科学・技術対話社会」に対する取り組み
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1. 子どもの幸福度を改善する方策を考えよう, 濱崎考史, 第49回日本マススクリーニング学会学術集会 市民公開講座, 2022/8/27, 国内.
国内
2. 「新しい新生児スクリーニング 〜先天異常疾患検査の進歩〜」について, 笹井英雄, 第32回 岐阜県子どもの健康を考える集い, 2022/10/22, 国内.
国内