本研究の開発の目的は、ミクログリアによる癌細胞の排除という生体内で観察された現象に着目し、ミクログリアと癌細胞の相互作用に関わる分子基盤を明らかにし、申請者らの開発した生体内イメージングモデルで機能解析することで、ミクログリアの機能を利用した癌の新たな治療を開発することである。
研究開発項目（１）：CNS生体内観察モデルと生体内標識を用いた多様な細胞の単離と解析：予定通りモデルに対する単細胞発現解析、腫瘍と腫瘍脳内微小環境に対するシングルセル解析データを取得し、さらに当初の研究計画を超えて実験系の改良（生体内標識スピードの倍速化）と空間トランスクリプトーム解析のデータ取得も行われた。これにより、分子基盤を解析するためのデータの取得が完了した。
研究開発項目（２）：マルチオミックス解析による多様性規定因子の抽出：取得したデータを解析して、治療効果のある相互作用因子を抽出した。計画していたとおり、マウスモデルに対するシングルセルRNAseq解析とヒト転移性脳腫瘍検体に対するシングルセルRNAseq解析が施行された。症例数は目標の３例を大きく超える６例を集積し、マウスモデルのシングルセル解析のデータと統合され解析が進められた。計画を超える内容として、近年盛んに行われている空間トランスクリプトーム解析（Visium）のデータをシングルセル解析と同一の検体で取得し、シングルセル解析のデータと統合しデータ解析を行った。これにより、これまでに得られていたシングルセル解析のデータにVisiumによる位置情報を付加できるようになり、イメージングによる情報にさらに付加情報を与えることができた。これらの網羅的解析から、治療ターゲットとして今後有望な因子を３因子抽出している。
研究開発項目(3) CNS転移生体内観察モデルを用いた、転移形成調節因子の検証：これら抽出した３因子については生体内観察モデルを用いて機能解析を行った。さらに、当初の計画予定を進展させ、特定の因子を欠失させたのち、さらに再度発現を亢進させて機能解析を行い、ターゲットバリデーションを行った。また、抗体治療を試すことで、治療効果の傍証を得た。一方でこれらは治療ターゲットとなりうる因子であることは証明されたが、その機序については不明な点があり、論文化のプロセスにあるとともに、機序についても機能解析を進めている。