本研究では、探索的なプロテオーム解析に先立って血漿プロテオーム解析プロトコルの開発を行った。血漿微量タンパク質解析法、血漿自己抗体結合抗原の超高感度解析法 （田口、阿部、奥本、特願2022-152089） を開発し、世界最高深度となる2,000個超の血漿微量タンパク質、1,000個超の自己抗体結合抗原が同定定量できるようになった。また、愛知県がんセンター内視鏡部、名古屋大学医学部付属病院消化器内科、名古屋医療センターと共同で、研究期間中に1,400例を超える血漿検体を大腸内視鏡検査受診者から収集した。血漿プロテオーム解析から同定した、11個のタンパク質バイオマーカー、13個の自己抗体バイオマーカーと6つの既存バイオマーカーについて、大腸腺腫から進行大腸癌まで含む150例の血漿検体を用いて初期検証を行った。11個の新規バイオマーカーでAUCが0.6を超え有望なバイオマーカー候補と考えられた。正常と大腸腫瘍性病変(低リスク大腸腺腫＋高リスク大腸腺腫＋早期大腸癌＋進行大腸癌)、正常と大腸ポリープ (低リスク大腸腺腫＋高リスク大腸腺腫)、正常と大腸癌(早期大腸癌＋進行大腸癌)の比較において、バイオマーカーの組み合わせはAUCがそれぞれ0.828、0.921、0.860であり、CEA単独のAUCである0.584、0.530、0.637を有意に上回った(P < 0.001、P < 0.001、P = 0.003)。特に大腸ポリープの診断において高い精度を達成しており、前癌病変である大腸ポリープの診断に有用であることが示唆された。