研究課題情報
課題管理番号
21tm0724603h0001
統合プロジェクト(二期)

ゲノム・データ基盤プロジェクト<第二期>

事業名

ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム<B-cure>

タグ(2021)

研究の性格: 研究基盤及び創薬基盤の整備研究<創薬技術・ICT基盤・プラットフォーム関係含む>

開発フェーズ: 基礎的

対象疾患: その他

疾患領域: 生活習慣病

開発目的: 予防・健康 ,  診断 ,  治療 ,  生活の質<QOL>

代表研究機関
国立大学法人岡山大学
研究代表者

(2021) 遠西大輔, 国立大学法人岡山大学, 岡山大学病院 ゲノム医療総合推進センター 研究教授

研究期間
2021年度 - 2021年度
課題への総配分額
83,330 千円
研究概要(2021)
岡山大学病院バイオバンク(岡大BB)に保存されている呼吸器疾患から呼吸機能検査でFEV1%(1秒率)が70%未満であり、閉塞性障害をきたすその他の疾患を除外できる症例をCOPD症例として、血液(PBMC)サンプルから核酸(DNA)を抽出し、40症例の全ゲノム解析(WGS)を実施する。またWGSを実施した同一COPD患者の肺組織・40検体から抽出した核酸(DNA)をもとに、全エクソン解析(WES)を実施する。同様に、肺組織から抽出した核酸(RNA)をもとに、網羅的な全トランスクリプトーム解析(WTS)を実施する。さらに同一肺組織を用いて、空間的(spatial)な位置情報を保持したトランスクリプトーム解析(VISIUM)を実施し、COPD組織内の局所における遺伝子発現プロファイルを明らかにする。この結果と合わせて、デジタル空間プロファイラー(GeoMx)を用いて、COPD組織内の空間的なタンパク質のプロテオーム解析(spatial proteome)を実施する。一方、正常コントロールとして、喫煙歴のある非COPD患者10症例に関しても、上記の解析を実施する。
研究成果情報
2021