（１）遺伝性腫瘍原因遺伝子のゲノム解析
（２）バイオバンク・ジャパンが保有する臨床情報との統合解析
　本年度は、バイオバンク・ジャパン保有の全23がん種および対照群の合計10万人以上について、遺伝性腫瘍原因遺伝子27個のゲノム解析を終了させた。そのうち、BRCA1・BRCA2について、14がん種横断的な解析を行った。その結果、1810個の遺伝的バリアントを同定し、ENIGMAガイドラインに従い315個が病的バリアントと判定された。
がん種毎に病的バリアント保持率を計算した結果、BRCA1は胆道がん、女性乳がん、男性乳がん、卵巣がんが、BRCA2は胆道がん、女性乳がん、男性乳がん、卵巣がんが、膵がん、前立腺がんが1%以上であった。続いて、各がん種について病的バリアントによる疾患リスクを計算したところ、すでに関連が知られている乳がん、前立腺がん、卵巣がん、膵がんに加えて、BRCA1は胆道がん(17.4倍)、胃がん(4.7倍)が、BRCA2は食道がん(5.6倍)、胃がん(4.7倍)においてP < 1×10^-4の有意な関連が認められた。また、BRCA1では肺がんとリンパ腫が、BRCA2においては子宮頸がん、子宮体がん、肝がん、腎がんがP < 0.05で関連を示し、幅広いがんにおいて発症との関連が示唆された。
続いて、病的バリアントを持つことにより、生涯で各がん種に罹患する可能性を示す累積リスクを求めた。その結果、両遺伝子との関連がすでに明確な4がん種のうち、BRCA2の前立腺がんにおいて85歳時の累積リスクは25%程度と、白人における結果の半分程度であった。また、新たな関連が見つかった3がん種においては、胃がんが両遺伝子とも85歳時における累積リスクは20%と最も高かった。以上のことから、両遺伝子の病的バリアント保持者には、新たなに関連が見つかったがん種について早期発見・予防の重要性を示唆すると共に、PARP阻害剤の治療効果が期待される。以上の結果は、JAMA Oncology誌に採択され、2022年4月15日に公開された。
（３） 薬剤投与・副作用情報の抽出とゲノムとの統合解析
日本大学・順天堂大学からバイオバンク・ジャパンに登録された乳癌、大腸癌、膵癌患者について、昨年度に入手したカルテ情報を精査した。Common Terminology Criteria for Adverse Events (CTCAE) v5.0に基づいて、G3以上の肝障害、心障害、腎障害、下痢、血液毒性が見られた症例を検索し、623症例を抽出した。全症例について、薬物動態関連100遺伝子を対象としたPKseqパネルを用いたゲノム解析を完了し、バリアント情報を取得した。各薬剤毎に関連解析を実施し、ALT、ALP、AST、血中ビリルビン (D-BilおよびT-Bil) の増加、低カリウム血症、貧血、血小板減少、好中球減少、白血球減少に関連する遺伝子を探索した。

（４）JCOGサンプルのゲノム解析
今年度は、本研究課題の対象となるJCOGの16試験で収集された1,537症例について、PKseqを用いた薬物動態関連100遺伝子のゲノム解析を完了し、バリアント情報を取得した。JCOGより臨床情報が提供可能であった14試験について、G3以上の有害事象、生存期間、無増悪生存期間、無再発生存期間などの診療情報を用いて関連解析を実施し、進行胆道癌患者を対象としたゲムシタビン/S-1併用療法における治療効果と関連する遺伝子などを同定した。