研究課題情報
課題管理番号
21jm0210078h0002
統合プロジェクト（二期）

シーズ開発・研究基盤プロジェクト<第二期>

事業名

医療分野国際科学技術共同研究開発推進事業

タグ（2021）

研究の性格： 研究基盤及び創薬基盤の整備研究<創薬技術・ICT基盤・プラットフォーム関係含む>

開発フェーズ： 基礎的

対象疾患： その他

疾患領域： 感染症 ,  がん

開発目的： 予防・健康 ,  治療

タグ（2020）

研究の性格： 生命・病態解明等を目指す研究

開発フェーズ： 該当なし

承認上の分類： 薬機法分類非該当

対象疾患： その他

疾患領域： がん ,  感染症

開発目的： 診断

代表研究機関
国立大学法人千葉大学
研究代表者

(2021) 福世真樹, 国立大学法人千葉大学, 大学院医学研究院　助教

(2020) 福世真樹, 国立大学法人千葉大学, 大学院医学研究院　助教

研究期間
2020年度 - 2021年度
課題への総配分額
4,946 千円
研究概要（2021）
ピロリ菌は胃癌の原因であるが、その機序はまだ解明されていない.世界人口の半数が感染し,その根絶は新型薬剤/ワクチンを必要とする.多様な配列特異的DNAメチル化酵素をもち、メチロームが多様である.米国国立癌研究所と200人の世界の臨床医/研究者によるピロリ菌ゲノムプロジェクト (HpGP) は,世界の胃癌と無胃癌の人から1000株を収集し、ゲノム・メチローム解読により,発癌関連の特徴を探索している.HpGPは、メチロームをPacBioで解読しているが、3種類のメチル化のうちm5C(5-メチルシトシン)については、信頼できる測定ができていない。本研究では、m5Cの信頼でき低コストの測定法を開発する。この方法を近縁度の異なるピロリ菌に適用し本年度は24株の解析を行う。5mCメチロームの進化を、遺伝子発現・表現型・病態と関係づけて理解し、「ある株の5mCメチロームを近縁株のものから予測する」ためのルールを探索する。その結果は、HpGPでの5mC解析する株数の決定に使われる。5mCメチローム進化の理解は、ピロリ菌だけでなく、私たちのマイクロバイオームを作る他の細菌の活動の理解にも役立つ。
研究概要（2020）
ピロリ菌は胃癌の原因であるが、その機序はまだ解明されていない.世界人口の半数が感染し,その根絶は新型薬剤/ワクチンを必要とする.多様な配列特異的DNAメチル化酵素をもち、メチロームが多様である.米国国立癌研究所と200人の世界の臨床医/研究者によるピロリ菌ゲノムプロジェクト (HpGP) は,世界の胃癌と無胃癌の人から1000株を収集し、ゲノム・メチローム解読により,発癌関連の特徴を探索している.HpGPは、メチロームをPacBioで解読しているが、3種類のメチル化のうちm5C(5-メチルシトシン)については、信頼できる測定ができていない。本研究では、m5Cの信頼でき低コストの測定法を開発する。この方法を近縁度の異なるピロリ菌に適用する。5mCメチロームの進化を、遺伝子発現・表現型・病態と関係づけて理解し、「ある株の5mCメチロームを近縁株のものから予測する」ためのルールを探索する。その結果は、HpGPでの5mC解析する株数の決定に使われる。5mCメチローム進化の理解は、ピロリ菌だけでなく、私たちのマイクロバイオームを作る他の細菌の活動の理解にも役立つ。
研究成果情報
2021
2020