抗動脈硬化作用を持つBacteroides２菌種(Bacteroides vulgatus, Bacteroides dorei)を微生物製剤として開発するための基盤を確立するために、(１)２菌種投与時の抗炎症作用機序を明らかにする実験と、(２) 動脈硬化以外の炎症性疾患モデルに対する治療効果を検証する実験、さらに（３）臨床応用のための基礎的実験を追加実施した。
(１)Bacteroides２菌種のLPSは、大腸菌LPSに比較して、炎症活性が弱いことがわかっている。マウスに投与しても敗血症性ショックにならないこと、動脈硬化マウスに投与しても、動脈硬化を増悪させないことを証明した。大腸菌の炎症惹起性LPS投与においては、新たな好中球の活性化機序を見出し、動脈硬化増悪機序を解明できた。
（２）動脈硬化以外の炎症性疾患モデルとして、高脂肪食肥満マウスモデルに対してのBacteroides２菌種投与の効果を検証し、肥満抑制効果を確認できた。肥満抑制の機序として、白色脂肪細胞へのマクロファージの浸潤抑制が関連していることがわかり、さらに、褐色脂肪細胞における分岐鎖高度アミノ酸(BCAA)代謝の障害が存在することを示すことができたし、術後に改善することがわかった。肥満外科手術の胃スリーブ切除術後に血中BCAA濃度が低下することがわかり、体重減少によって同代謝の改善が起こることがわかり、ヒトとマウスに共通して起きる現象として示すことができて、治療標的としての可能性を検証している。
（３）新たなBacteroides２菌種株をヒト糞便から複数単離して、最もマウス動脈硬化を抑制できる菌株の組合せを特定した。現在、その動脈硬化抑制作用を基準にして、菌株の遺伝子解析を行い、比較ゲノム解析を実施中であり、動脈硬化抑制関連遺伝子の同定を目指す。臨床応用のため、最も効果のある組合せ菌株を微生物製剤として、経口投与もしくは糞便移植の代替としての大腸投与の効果を検証した。驚くことに、経口投与では効果が認められるが、経肛門投与ではほとんど効果が認められないことが分かった。さらに、効果の証明されている生菌製剤とフリーズドライでの差異を検証している。