研究課題情報
課題管理番号
21fk0410023h0003
統合プロジェクト(二期)

疾患基礎研究プロジェクト<第二期>

9つの連携分野プロジェクト

その他<第一期>

事業名

感染症実用化研究事業 ,

エイズ対策実用化研究事業

タグ(2021)

研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究

開発フェーズ: 基礎的

対象疾患: その他

疾患領域: 感染症

開発目的: 予防・健康 ,  診断 ,  治療

タグ(2020)

研究の性格: 研究基盤及び創薬基盤の整備研究<創薬技術・ICT基盤・プラットフォーム関係含む>

開発フェーズ: 基礎的

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: その他

疾患領域: 感染症

開発目的: 治療

タグ(2019)

研究の性格: 研究基盤及び創薬基盤の整備研究<創薬技術・ICT基盤・プラットフォーム関係含む>

開発フェーズ: 該当なし

承認上の分類: 薬機法分類非該当

対象疾患: 感染症および寄生虫症

代表研究機関
国立大学法人熊本大学
研究代表者

(2021) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター・教授

(2020) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター・教授

(2019) 佐藤賢文, 国立大学法人熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター・教授

研究期間
2019年度 - 2021年度
課題への総配分額
117,000 千円
研究概要(2021)
1. 潜伏感染機序解明に向けたシングルセルデータ取得として: 1年度目のタイマー蛍光タンパク搭載HIVを用いてJurkat細胞へ感染実験を進める。さらにウイルス感染ダイナミクスが観察可能なHIV持続感染細胞をPrimary T細胞で樹立する。Jurkat T細胞と同様にタイマー蛍光タンパクによるウイルス感染ダイナミクス測定を行う。異なる感染状態の細胞をソーティングして、scRNA-seqデータ取得を行う。取得されたscRNA-seqデータについて、Bioinformatics解析を行う。3年間の研究の総括を行い、治療標的創出へ向け候補分子の絞り込みを行う。2. 持続潜伏感染維持に関わる宿主因子機能解析として: 1、2年度目に引き続き潜伏感染制御宿主候補要因データベース構築作業を継続するが、2年目の研究は1年目で得られた候補遺伝子の機能解析、特に潜伏感染に関わるメカニズム解析に重心を置く。主にクロマチン免疫沈降法やATAC-seq解析など必要性に応じて研究を推進する。また薬剤標的としての適性を評価する。
研究概要(2020)
タイマー蛍光タンパクを搭載した組み換えHIV感染細胞を樹立して、ウイルス潜伏化・活性化状態の時間情報解析を可能にする実験系を確立する。樹立した感染細胞系を用いて、FACSによるタイマー蛍光タンパク情報を測定することで、ウイルス感染のダイナミックな解析を可能にする。更に、それぞれの細胞分画を分収して、単細胞トランスクリプトームデータ取得をChromium社のシングルセル解析システムを用いて行う。シングルセルトランスクリプトームデータをつなぎ合わせて、擬似的な時系列データを再構成する手法が報告されている。感染細胞集団の一部から潜伏感染細胞が生まれる過程を連続時間的に捉えることが可能となり、潜伏感染成立動態を定式化する多階層数理モデル構築に必要な基礎データを取得する
研究概要(2019)
タイマー蛍光タンパクを搭載した組み換えHIV感染細胞を樹立して、ウイルス潜伏化・活性化状態の時間情報解析を可能にする実験系を確立する。樹立した感染細胞系を用いて、FACSによるタイマー蛍光タンパク情報を測定することで、ウイルス感染のダイナミックな解析を可能にする。更に、それぞれの細胞分画を分収して、単細胞トランスクリプトームデータ取得をChromium社のシングルセル解析システムを用いて行う。シングルセルトランスクリプトームデータをつなぎ合わせて、擬似的な時系列データを再構成する手法が報告されている。感染細胞集団の一部から潜伏感染細胞が生まれる過程を連続時間的に捉えることが可能となり、潜伏感染成立動態を定式化する多階層数理モデル構築に必要な基礎データを取得する
研究成果情報
2021
2020
2019