認知症は遺伝的因子と環境因子が交絡して発症する。APOEなど認知症に関連する幾つかの遺伝子が同定されているが，分子病態の根本的な解明には至っていない。大規模な日本人認知症ゲノムサンプルを活用し，全ゲノム/エクソーム解析，ゲノムワイド関連解析（genome-wide association study）等の網羅的解析により認知症に関する遺伝的要因を同定することを目的として本事業を行った。本事業では，5つの研究開発項目を推進した。1)「クリニカルシークエンスと認知症ゲノムコホート構築」においては，遺伝的要因の関与が高い家族性/若年性認知症等のクリニカルシークエンスを実施した。クリニカルシークエンスの結果は，依頼医にフィードバックし，臨床診断に役立てた。2)「新規レアバリアントの同定」においては，認知症患者/健常対象者の全ゲノム/エクソーム解析を実施し認知症に関連するレアバリアントを同定した。認知症と対照者の比較に加え，アンチ認知症集団である百寿者の全ゲノム解析を行った。同定されたレアバリアントは，大規模なゲノムコホートサンプルを用いた検証を行った。3)「GWASによる新規感受性遺伝子座の同定」では，日本人の認知症患者/健常高齢者のサンプルを用いたアレイ解析を実施した。日本人全ゲノムリファレンスパネルを用いたインピュテーションによる擬似全ゲノム配列を取得するとともに，既存のGWASデータとのメタ解析を実施し，欧米人種とは異なる感受性遺伝子を明らかにした。4)「剖検脳リソースを活用したマルチオミックス解析」では，日本ブレインバンクネット（JBBN）との連携の上，認知症剖検脳由来のDNA/RNAを用いた解析を進めた。5)「インフォマティクスを用いた統合解析」では，解析データを認知症データストレージ（DS）に集約し，本研究班内で共有した。網羅的遺伝子解析データに基づいたインフォマティクス解析を実施し，多遺伝子効果を考慮したポリジェニックリスク（PRS）/ハザードスコア（PHS）のモデル式を日本人解析データにより構築した。本事業で取得されたゲノム解析データは，MGeND/CANNDsに登録し，それぞれ非制限公開/制限公開/制限共有を行うことによりデータシェアリングを促進した。