免疫ゲノム解析のための解析パイプラインを確立し、ICGC/TCGA での 2800 例の全ゲノムと RNAseq のデータを用いて Pan-Cancer 免疫ゲノム解析を国際連携のもと行った。Immune-Editing の程度の指標を開発し(IEI)、免疫療法が奏功する MSI 大腸がんや肺がんでは Immune-Editing をうけてきていることが判明した。Ｔ細胞 HOT/COLD での GSEA をおこない、臓器別に、COLD 腫瘍と相関する signal pathway を複数同定しており、肺がんや食道がんにおいては細胞周期関連が COLD と強い相関が認め、大腸がんや肝がんでは胆汁酸代謝や Wnt-β-catenin signal pathway が COLD と強い相関があり、これらは複合免疫療法の標的となる可能性がある。234 例の肝臓がんの RNA-Seq データを免疫ゲノム的な観点から再解析を行い、体細胞変異のデータとの統合解析を行った。腫瘍内での免疫抑制機能に着目して、Treg 群、TAM群、β-catenin 群、そして免疫抑制機構不明の４つ群に分類を行った。この免疫 Signature と関連する肝がんドライバー遺伝子変異として、β-catenin 以外に、ARID2 変異が TAM 浸潤との関連を認め、ARID2の変異により腫瘍がケモカインの発現を変化させていることが判明した。食道がんについて 133 例の術前化学療法（CDDP+5FU が基本）前の生検サンプルを収集し、RNA-seq と low pass WGS を行い、Copynumber signature と TIL 分画が化学療法の感受性と関連することを明らかにした。これらの情報を用いて、機械学習にて化学療法感受性予測のアルゴリズムを構築し、再現性を確認した。可移植性同系マウス細胞を合計 14 株取得し、腫瘍組織の RNAseq 解析を経時的におこなった。CTL 細胞発現プロファイルより、これら 14 株の移植マウス腫瘍の HOT/COLD の分類をおこない、臨床サンプルでの GSEA の結果を参照にしながら、HOT/COLD と相関する signal pathway を複数同定し、複合免疫療法の標的となりえるものと考える。