今年度の課題として、３年間の研究内容をまとめて論文発表することを掲げた。独自に開発したT-iPS細胞の作製方法と評価法に関する論文（論文１）に関しては、本研究にて行ったsingle-cell RNA-seq解析の内容に照らし合わせて、現行のiPS細胞の分化抵抗性がこの細胞の胚体外組織への分化偏向性にあることを突き止め、論文を完成させ、bioRxivへの登録およびNature Biotechnologyへ投稿中である。
大阪医科薬科大学においては大脳、中脳腹側、脊髄運動領域への分化誘導条件の導出に成功しており、今年度はT-iPS細胞株を用いて、分化前・後の性質を詳細に調べた。従来のiPS細胞株とT-iPS細胞株の分化能を調べたところ、上記領域のいずれにおいても、T-iPS細胞株で分化効率が高いことが明らかになった。論文1では、T-iPS細胞由来のドパミン神経細胞がこれまでのiPS細胞由来の同種細胞に比べて、その分化効率および機能面でも優れていることに言及している。また、T-iPS細胞株において、神経細胞体から伸長する樹状突起の数や長さがT-iPS細胞株において向上しており、より機能的な神経細胞が誘導されていることが示唆された。このような機能性に優れた神経細胞の導出技術は、今後、毒性試験のテスター細胞として有効利用できると考えている。
千葉工業大学においては、T-iPS細胞、従来型iPS細胞のゲノムのメチル化情報、及びiPS・ES細胞、胚盤胞のゲノムメチル化情報をIGVビューワで可視化し、T-iPS細胞の中でも特に優良な1T47株に特有なゲノムメチル化の領域（DMR）の探索を行った。上記探索の結果、いくつかのDMR候補領域のうち、メチル化と相関するようにRNA発現が見られたもの（3カ所）に関して、iPS細胞のRNAからRT-PCR法により発現の確認を行った。
T-iPS細胞のエピゲノム特性、とくにDNAメチル化状態を解析した結果、iPS細胞初期化における山中因子の働きや、その際に担うTET1の役割が明らかになったため、これをまとめた論文の執筆中である（論文２）。この完成のため、追加予算にて施行したDNAメチル化を指標とした独自の「iPS細胞判定指標」を割り出し、その検証を行う準備が整った（※ライブラリー作製済み）。
　論文１にて言及しているが、iPS細胞の遺伝子発現ゆらぎを解析した結果、この細胞集団においては様々なレベルでのゆらぎが認められた。我々は、この羊膜分化への偏向性が、現行iPS細胞の重要な「欠陥」であることを見出した。その原因についてもすでに解明できており、論文（論文3）の執筆を開始している。