SARS-CoV-2スパイク蛋白のReceptor Binding Domain (RBD)を発現する組換えBCGの構築を行った。組換えBCGの親株としてBCG Tokyo172を用い、プラスミドを用いるもの、ファージベクターを用いてBCGゲノムに挿入するもの、相同性組換えでBCGゲノム挿入するそれぞれのパターンの構築を行い、RBDを産生する組換えBCGを得た。RBDの産生は、S蛋白に対する抗体反応と質量分析により行い、分泌蛋白質のSDS-PAGE、CBB染色で組換えBCG特異的なエキストラバンドを確認した。
作成した組換えBCGのうち、ゲノム挿入型rBCGの1株を用いて、RBDとの単回共免疫により、マウスに免疫を行った。ELISAによって6週後以降に、経時的に上昇する抗RBD抗体の産生を認め、免疫8週後の脾細胞リンパ球のRBD 刺激により、IFN-gamma産生を認めたことから、ワクチン接種により、RBDに対する継続的な免疫応答を誘導できることが分かった。
SARS-CoV-2のスパイク蛋白質を外套する組換え偽型レンチウイルス（S-virus）を作成した。S-virusは、SARS-CoV-2感受性細胞特異的に感染した。S-virusを用いて、市販抗体やSARS-CoV-2感染ハムスター由来血清の中和活性を測定したところ、提供者から提示された値と同等の値を得ることができたことから、ワクチン接種動物の中和抗体活性測定系を構築できた。
nextstrain.orgで提供されている約3万症例由来のSARS-CoV-2ゲノムの遺伝子変異データを取得し、採取エリアや採取時期などのメタデータを用いて解析を実施した結果、時系列に遺伝子変異の変遷が観察できるようになり、流行の原因になる遺伝子変異のモニタリングが実施した。本邦における、武漢型から欧州型への流行変遷とN501Y変異株の流行拡大を検出した。